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第七章个体遗传评定-blup法
对于y,总可以找到一个线性函数 ,它满足 ,使得: 亦即 不受固定效应影响。 若y服从正态分布,则 也服从正态分布,即: 的对数似然函数,也即约束似然函数的对数为: 其中,C为一常数,且有: n 为有记录的个体数, 为固定效应关联矩阵的秩。 求解上述对数约束似然函数关于 和 的最大值,便可得到 和 的REML估值。 于是: REML和ML的区别 思路上:ML是求观察值的似然函数的最大值;而REML是求观察值的某一特定线性函数的似然函数的最大值。 结果上:由于 不考虑估计固定效应,因此,REML法克服了ML法中产生有偏估值的一个来源,即克服了ML法中因估计固定效应而造成的自由度的损失。 REML和ML的相同点 都具有大样本特性,即小样本数据估值有偏。 非求导的REML—DFREML DFREML、MTDFREML、DMU 求一阶偏导数的REML—EMREML VCE、REMLF90 利用一阶和二阶偏导数的REML—AIREML DFREML、AIREMLF90、VCE、DMU REML的有关算法与相关软件 约束与假设 所有犊牛都来自同一个品种; 母亲年龄对犊牛体重无影响; 犊牛的性别相同或性别对体重无影响; 除日龄组外的其他环境条件相同。 对每一观察值建立方程式 y11=198= ? + a1 +e11 y12=204= ? + a1 +e12 y13=201= ? + a1 +e13 y21=203= ? + a2 +e21 y22=206= ? + a2 +e22 y23=210= ? + a2 +e23 y31=205= ? + a3 +e31 y32=212= ? + a3 +e32 y33=216= ? + a3 +e33 y41=225= ? + a4 +e41 y42=220= ? + a4 +e42 日龄组 1 2 3 4 观察值 残 差 个 体 1 2 3 4 日 龄 组 y11 =198= ? + a1 + e11 y12 =204= ? + a1 + e12 y13 =201= ? + a1 + e13 y21 =203= ? + a2 + e21 y22 =206= ? + a2 + e22 y23 =210= ? + a2 + e23 y31 =205= ? + a3
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