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利用测序水稻品构建重组自交系群体及SSR遗传连锁图谱的初步制作研究.pdf
摘要
承稻是整赛上最黧要瓣羧食箨物之一,整赛上半数馥上鹣入蜀强庆强为主
食,大多数水稻重要农艺性状如产擞、品质、抗逆性等多为数量性状,因此对数
量性状基因位点(QTLs)准确定位分析在水稻遗佟改良上具沓爨要意义。尤其是
羁溪全蒸因缀竞戒溺溶簸专辛耱进行数量毪获骚究,为逡一步野袋QIL功能辩援打
下基础,本研究选用两个测序水稻晶种“培矮64S和Et本晴”,配制杂交组合“培
330个株系”,并对RIL群体进行
矮64S1E1本晴”FI构建重组自交祭群体“F2:6
译徐,耀该嚣体稳建了。张SSR猿记连铰霞谱“鬻称F6踅落”,貉该銎分麓与糖
同组合F2群体图谱和日本晴序列圈比,分析分离标记的概况,并对分蘖数、穗数、
株高等3个性状进行了QTL分析,蕻主要结果如下:
四川和海南种植;F2、F4、F6在四川温江种植,Fl、F3、F5在海南凌水种植,最
后得330个F2.6株系。重组自交系RIL群体性状评检测评价结果为;分蘖数、穗
数、撩麓3类往欹缝合度分蠲为60。61%、90%、50.61%,分孑标记评侩缩聚为;
RIL群体纯合度为96.03%,杂合度为3.97%。
2.选用515对SSR引物对双亲培矮64S和隧本晴闻进行多态性检测,露157
对;l秘农双亲闼表瑰鳃显多态毪,多态往频率为30。48%,越魏擒建了包含92令标
记的连锁图“简称F6图谱”,该图谱包含17个邂锁群,覆盏糕因组2563.5cM,
标记间平均距离27.86cM。
3.零黧谱分剐与F2餮谱迸{亍魄较,两蚕在连镁群、标记怒位数、标蠢颓穿、
总基因组长度、标记平均距离等都存在差异。进一步与日本晴序列图比较,92
个标记肖74个标记能确定在基因缀序列图上,帮18个标逸朱能在序列图找到相
应豹经鬻,74个标记覆盖的勃瑾鞭离为159,8Mb,标记闽平璃物理距离为
2159.46kb。
4在RIL群体中偏分离标记较多;定位在F5图谱有63个分子标记表现偏分
离fPO.05),占定位豁记数的68.48%,这些擦分离标记中有60个偏商母本壤矮
64S,只有3个标记偏向父本日本晴:另外还有65个未定位标记,其中27个标
记偏分离、38个正嚣分离。
5.F6窝上lO祭染色俸上共分布了60个褊分离标记,占稳分离标记的95.24%,
这些标记以成簇的形忒分布在染色体,形成偏分离的热点区,分别命名为:
SDRl2。冗乎掰有热点区域郝德
SDR6.2、SDR8、SDR9-1、SDR9+2、SDRIl拳1
wai64S,SDRI.1区域有2个标记偏向父本日本晴,珂:在热点区域内的
向母本Pei
偏分离橱汜在染色体上均为孤立分散分布。
6.;}l{弼区闻箨翻法检测至《控躐分蘖数2个QTLs、穗数豹1令,没有检测至《控
制株商的基因座位点。
关键词:水獯RIL群体构建SSR标记遗传图谱QTL定位
Abstract
oneofthe forhuman foodfor
Riceis majorcrop consumption,providingstaple
traitsofrice
morethallhalfofworld’S importantagronomic are
population+Most
are
as andstressresistanceandSOon,whichcontrolled
quantitative,suchyield.quality
It’S forrice to
breedingimprovementmapquantitative
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