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猕猴桃种质资源apd分析及芽变scar标记研究
摘要
猕猴桃属植物种类繁多,全世界有66个种,约118个种下分类单位(变种、变
型),其栽培品种也较多,主要是中华猕猴桃和美味猕猴桃。猕猴桃为多年生藤本果
树,生长周期长,用常规方法进行遗传基础研究,效率不高;、由于地理分布的重叠和
种类间的自然杂交,产生了多种中间过渡类型,使其种间和种内品种的界线并不十分
清晰,增加了猕猴桃遗传变异研究的难度。
本文以猕猴桃10个种、34个栽培品种共42个生物型的叶片为试验材料,采用
了逐个优化,建立了猕猴桃基因组RAPD分析的最佳反应体系。即总反应体积20uL,
025mmol·L~,引
Taq酶1.0U、模板DNA80ng、MgCl21.25mmol·L~、dNTPs
物1.0 min:94(2变性lmin,37。C退火1
ng·gL~。PCR热循环参数为94℃预变性5
rain.72℃延伸2min,循环40次:最后在72℃延伸6min。
试验从80个随机引物中筛选出了扩增结果稳定、谱带清晰的引物38个,进行
1 1.0forWindows软件进行聚类分析。
聚类分析结果显示,中华猕猴桃“武植2号”和美味猕猴桃“哑特”在距离系数
为46.0时聚为一类,说明美味猕猴桃和中华猕猴桃亲缘关系较近:美昧猕猴桃品种
“米良1号”、“青城l号”和绝大多数中华猕猴桃品种聚类距离系数为964,所有的
美味猕猴桃和中华猕猴桃品种聚类距离系数为104.5,且聚类的先后秩序有交叉现象。
因此,根据RAPD分析结果,认为将这两个种归为同一个种更为合理;“川猕l号”
和“川猕2号”、“徐香”和“徐冠”、“华美l号”和“华美2号”、“武植2号”和“武
植3号”都分别在较近的距离水平上聚在一起,说明猕猴桃品种之间确有按原产地聚
类的趋势。
一图谱,可将猕猴桃42个生物型中的12个生物型区别开来。
“皖翠”是1993年发现的“海沃德”自然芽变新品种,由安徽农业大学园艺学
院选育。本试验研究发现,“海沃德”与“皖翠”在38个随机引物扩增中,有14个
引物出现了18条特异带,说明“皖翠”在DNA水平上呈现了较大范围的的变异。
bp、
从“海沃德”与“皖翠”的18条特异带中,选择了两条分子量分别为740
649 bp
bp的特异带,进行了分离、纯化、克隆与测序,根据测序结果设计出4条20
的特异引物,再进行SCAR—PCR扩增。
SCAR-PCR扩增结果,分子量为649
bp的特异带在“皖翠”与“海沃德”中都
扩增出了条带,说明“皖翠”这一RAPD扩增特异带并不存在:“皖翠”扩增出现了
分子量为740bp的特异带,而“海沃德”未出现此带,证明“海沃德”与“皖翠”存
在此变异位点,成功地将“皖翠”变异的RAPD标记转化为SCAR标记。
关键词:猕猴桃,种质资源,RAPD分析,SCAR标记
n
Abstract
Thereareabundant resourcesin Actinidiainthe 66
germplasm genus
and118 taxononicunits.ThevarietiesinA.chinensisandAdeliciosa
species intraspecies
were cultivatedinkiwifruit a vinefruitthe
extensively production.Asperennial growth
ofkiwifrUitisso thatthe isnotefficien
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