适于高通量测序分析混合DNA的STR复合体系构建和应用研究.pdfVIP

I呲V叭2吣7吣8帆5呲哪4吣2帆7唧 目 录 中文摘要……………………………………………………………………1 英文摘要……………………………………………………………………4 英文缩写……………………………………………………………………7 研究论文适于高通量测序分析混合DNA的STR复合体系构建及应用研 究 前言………………………………………………………………………．．8刖舌………………………………………………………………………．．8 材料与方法………………．………………………………………………9 结果…………………．．…………………………………………………20 附图……………………………………………………………………．．22 附表……………………………………………………………………．．30 讨论……………………………………………………………………．．38 结论……………………………………………………………………．．43 参考文献………………………………………………………………．．43 综述新一代测序技术在法医DNA分析上的应用………………………．47 致谢…………………………………………………………………………．．62 个人简历……………………………………………………………………．．63 万方数据 中文摘要 适于高通量测序分析混合DNA的 STR复合体系构建及应用研究 摘 要 mixture tandem 联重复序列(short (capillary 的结果对混合斑DNA的解释提出了难题，主要是由于STR基因座中复合 序列(compoundrepeats)和／或复杂序列(complex repeats)的存在导致 CE分离技术无法得到STR基因座的全序列信息。而当前快速发展的新一 代测序技术(Next-generation 基因的高概率精确判断的严谨性，还能够获得STR等位基因间的核苷酸 差异(nucleotide 合DNA分析中的关键要素使得反解混合样本的概率模式简便高效化。 5个常染色体STR，应 本研究选用AmpFLSTR@Identifiler@体系中的1 用NCBI．primer-blast、primer 度比控制在1：4之内，通过片段分析技术(fragment analysis，FA)直观、 产物进行高分辨率(1％)分离的片段分析方法，将以上15个STR基因 座分成2组分别构建成2个PCR多重扩增体系以适用于新一代测序平台 对混合DNA高效便捷准确的分析，并对该复合分型体系的混合DNA分 析价值进行初步评价。 15个常染色体STRs基因座(D8Sl179，D21S1 的 参 考 序 列 ， 应 用 引 物 设 计 网 站 万方数据 中文摘要 及引物设计软件primer http：／／www．ncbi．nlm．nih．gov／tools／primer-blastl PCR Master Mix(ABI)合理调整体系内引物及引物浓度，使得分