碱基切除修复与分枝杆菌基因组稳定性.pdfVIP

中国细胞生物学学报 Chinese Journal of Cell Biology 2011, 33(3): 327−334 碱基切除修复与分枝杆菌基因组稳定性 胡　锦　谢建平* (西南大学生命科学学院现代生物医药研究所, 重庆400715) 摘要　　维持基因组稳定是生物生存的基础。碱基切除修复(base excision repair, BER)是修复 损伤DNA 、维持基因组稳定的主要方式之一。碱基切除修复对结核分枝杆菌等胞内致病菌尤其重 要。fpg 编码碱基切除修复的关键酶。本文通过比较分枝杆菌的基因组, 发现结核菌较其他非致病 分枝杆菌具有更多的碱基切除修复基因。这提示碱基切除修复可能对结核菌在宿主体内存活和致 病至关重要。这条途径也许是新结核病药物研发的重要靶标。 关键词　　DNA 损伤; 碱基切除修复; 甲酰嘧啶-DNA- 糖基化酶; 结核分枝杆菌 基因组的适度稳定性是生物生存的基础。DNA 1 FPG 概述 修复(DNA repair)是细胞应对危害基因组稳定的DNA 高活性氧中间物会损伤细胞的糖类、脂类、 损伤的方式之一。它可恢复受损的DNA 结构并执 蛋白质和DNA 等[6] 。FPG( 甲酰胺嘧啶-DNA 糖基化 行正常的生理功能。切除修复(excision repair)、回复 酶[7])也称作8- 氧鸟嘌呤(8-oxoguanine)DNA 糖基化 修复/ 直接修复(direct repair) 、错配修复(mismatch 酶, 其既有N 端糖基化酶活性也有AP 裂解酶活性[8] 。 repair) 、重组修复(recombinational repair)、SOS 修复 N端糖基化酶活性可以降解双链DNA上受损的嘌呤 和限制——修饰系统是修复相关的主要途径。 碱基, 产生一个脱嘌呤位点(AP 位点) 。AP 裂解酶活 DNA 损伤的修复能力对胞内致病菌至关重要。 性可以沿3 或5 向AP 位点切割, 因此可以除去AP 因为它们寄生生活的环境经常具有高水平的活性氧 位点, 产生单个碱基的缺口( 图1)。FPG 识别并切除 或活性氮。生物体中约60 种反应以氧为反应底物, 的受损碱基包括: 7,8- 二羟基-8- 氧化鸟嘌呤(8- 氧化 产生对机体有害的活性氧。DNA 氧化性损伤程度 鸟嘌呤) 、8- 氧化腺嘌呤、fapy- 鸟嘌呤、甲基-fapy- 过高不仅会导致细胞癌变, 也会导致其他疾病[1,2] 。 鸟嘌呤、fapy- 腺嘌呤、黄曲霉毒素 B1-fapy- 鸟嘌 结核病(Tuberculosis, TB)是严重危害全球公共健康 呤和5- 羟基- 胞嘧啶和5- 羟基- 尿嘧啶(1,2) ( 图2) 。 [3,4] 根据作用机制, DNA糖基化酶大致可以分为两 的重大传染病 。目前世界上1/3 的人口感染过其 致病菌——结核分枝杆菌( 以下简称结核菌) 。结核 类: 一类是单功能酶类, 另一类是双功能酶类。单 分枝杆菌是胞内致病菌的成功典范。其基因组富含 功能酶对受损碱基进一步催化, 用激活的水分子攻击 G+C, 尤其易于受到氧化性的损伤。但是, 结核菌 C1 位点。双功能酶也需要切除损伤碱基, 但攻击用 能够高效修复DNA 氧化性损伤。这可能是结核菌 的不是激活的水分子, 而是蛋白氨的亲核基团。共 成功的因素之一。 价连接的酶- 底物复合物经过多步级联反应在3 端 碱基切除修复(base excision repair, BER)是切除 切断DNA骨架, 有时甚至在5 端产生DNA骨架的断 修复中的一种。其涉及的主要为DNA 糖基化酶和 裂( 图3 ) 。 DNA 聚合酶。单碱基突变主要经此途径修复。BER 细菌FPG 编码基因和人的hOGG