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RNA线常见问题汇总 Q: 1、如何确定研究物种有无参考基因组？ A:根据研究物种的拉丁文名,可在Ensembl （/index.html）、JGI(/ ) NCBI(/)中搜索是否有该物种的基因组信息，也可 在其他专门介绍某种物种的网站寻找参考基因组。 一般下载的文件包括 ：Assembledscaffolds(masked)、Genes 、Functional Annotations 三种文件；需要下载的文件具体如下： 1）序列信息：.fasta 文件，用于进行 mapping 比对。 2)基因注释信息 ：.gff 文件 ，里面包含基因名字 ，基因所在位置等信息 ，用于 进行测得序列的基因注释，注释所得基因可以进行下一步表达差异分析。 3)GO 注释信息 ：.txt 文件 ，里面包含基因名字和对应注释信息编号（GO 号）， 有此信息可以不用再重新进行 GO 注释 ，直接利用此信息进行 GO 富集分析。 Q: 2、送样要求？ A: 1) 组织样品 7 动物组织：＞ 2g ；植物组织：＞ 4g ；培养细胞：＞1×10 个； 血液样品：≥ 2ml （最好是全血） 2)真核生物 RNA 请提供浓度≥ 200ng/μL，总量≥10μ