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2006-207年狂犬病毒野毒株l基因3′端及聚合酶活性部位序列分析
2006-2007年狂犬病毒野毒株L基因37端及聚合酶活性部位
序列分析
摘 要
狂犬病是由狂犬病病毒所引起的一种烈性人兽共患传染病。近年来,
广西狂犬病对人民的生命安全造成了严重的威胁。现在已经做了许多分子
流行病学的研究,以便更好地了解狂犬病毒的进化。本研究对广西11株狂
犬病毒L基因的37端和聚合酶活性部位进行了克隆和序列分析。然后将所
得序列和实验室保存毒株序列一起与国内外公开发表的狂犬固定毒、狂犬
相关病毒的序列对应部分进行序列比较。结果表明,广西毒株之间同源性
较高,37端的核苷酸和氨基酸同源性分别为85.6%-100.O%和
92.0%-1
00.0%,聚合酶活性部位的核苷酸和氨基酸同源性分别为
7端
位核苷酸和氨基酸同源-I生分别为76.8%-97.8%和94.0%-100.O%。分析氨基
7、19、48、73、74、93、
酸序列变异位点发现,37端突变主要发生在2、1
136和1
1 7-1
45和157位,而且在1122位点存在严格保守的核心序列“AQGDNfl”。
对本研究野毒株的L基因37端和聚合酶活性部位的序列分析结果表明,
广西毒株之间亲缘关系近,与狂犬固定毒亲缘关系较远,与狂犬相关病毒
最远。据遗传进化分析,所有广西毒株均属于基因I型。本研究毒株在实
验室保存毒株已经分为I、II、ⅡI三个群的基础上可以并入已有群,具有
1
GX014、GX091、GXl
GXLAl 9、
1
GX304、GXBM、GXPX的II群;而III群内仍只有GXNl
9,无新毒株划入。分析
结果与N、G基因相符。
关键词:狂犬病毒;L基因3’端;聚合酶活性部位;序列分析
Ⅱ
7
ANALYSISOF3TERMINALAND
SEQUENCE
ACTIVITYMoDULEINLGENE
POIjYMERASE oFRABIES
WILD IN
VIRUSSTRAINSGUANGXIFROM2006TO2007
ABSTRACT
RabiesisanacutezoonoticinfectiousdiseasecausedRabiesvirus
by
recent hasbeenahorriblethreattoour life in
safty
(RABV).Inyears,it people’S
molecular studiesofRABVhavebeen
guangxi epidemiologic
province.And
e
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