2007～209年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒orf5基因和nsp2基因高变区的遗传变异分析.pdfVIP

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2016-02-20 发布于贵州
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2007～209年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒orf5基因和nsp2基因高变区的遗传变异分析.pdf

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2007～209年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒orf5基因和nsp2基因高变区的遗传变异分析

基因高变区的遗传变异分析摘要猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是严重影响世界养猪业发展的病毒性疾病。由于其病原体猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的基因组中OI讧5 基因和Nsp2基因变异大，所以常用这两个基因来监测本病的流行情况。猪场流行。毒株的相应核苷酸序列进行比较。对ORF5基因比较后构建系统进化树，发现所有的广西毒株均属于北美型，可以将广西PRRSV毒株分为两群。I 群包含3株广西株，与北美型代表株VR-2332和由它衍生的弱毒疫苗株和亚群2。亚群1由6株广西毒株独立形成，其氨基酸变异表现出地域特性。亚群2所包含的46株广西株与JXAl同群，它们之间的核苷酸和氨基酸同趋势。本研究所克隆30株广西毒株的ORF5基因均属于II群，其中亚群1 T 包含6株，亚群2包含24株。 Nsp2基因高变区序列推导的氨基酸与国内外参考毒株的相应氨基酸序是新发现的一种类型的变异株。其中发生30个氨基酸缺失的毒株与高变株基酸的缺失。相同的变异趋势；(4)广西地区存在四种类型的变异形式，a补N06是新现出遗传多样性，推测Nsp2基因的进化可能是一个逐渐变异和积累的过程。 OI疆5 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒(PI水SV) Nsp2遗传变异分析 Ⅱ GENETICVf6埘ATl0NANALYSISBASEDONORF5AND HIGHVARIABLEREGIONOFNSP20FPORCINE REPRODUCTIVEANDRESPIRATORYVIRUSINGUANGⅪ PROVINCEFROM2007TO2009 ABSTRACT Porcine and (PRRS)isconsideredto reproductiverespirato叮syndrome i11 beoneof廿1emost infectiousdiseasesswine and seriously indust】呼OI心5 wereusedtomonitorthemolecular onaccountof Nsp2genes epidemiology theirextensiVeV撕ationin ofPRRSV genome In clinical werecollected丘omdifferent mis咖dysuspectedsamples swilleherdsin tomonitor in2008～2009．136of180 Guangxi epidemiology were ImPCRandthe rateis75．6％．Theresultindicated positiVeby positiVe PI狠SVwas in herd time． preValentGumg)(id嘶ng“s andthe were ORF5 of clonedand gene hi曲V撕ableregionNsp2gene