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氟烷基因在中国方猪种中的分布及其pcr产物序列多态性研究
中文摘要
氟烷基因是导致猪应激综合征、影响猪肉品质的一个主效基因。rln型个体表现
对应激敏感,胴体出现较高频率的PSE肉,给养猪生产造成严重的经济损失。
本实验采用PCR—RFLP技术检测了中国地方猪种成华猪、雅南猪、内江猪和太湖
猪的氟烷基因型,并对氟烷基因PCR产物序列多态性进行了分析。
太湖猪62头,雅南猪30头。)氟烷基因型均为NN。
在本次研究中,总共测定了五个品种(四个地方猪种和一个外种猪)16个个体
进行分析,分析结果表明:在这21条序列中,共发现16个变异位点,根据这些变
异位点界定出15种单倍型。在这些变异位点中,其中有三个为颠换,其余的为转换。
在这些变异位点中,内江猪四个个体18662位碱基均为T,而其它品种则无此突变,
T18“2为内江猪品种特征。在其他品种内并未发现其他有品种特征的碱基突变。
所测16条序列碱基组成相似。对这些序列进行分析,品种内的单倍型多样度和
核苷酸多样度以及品种问的群体问平均核苷酸差异数(K)、群体问平均每位点核苷
酸替代数(Dxy)、每位点净核苷酸替代数(Da)都较低。用双参数模型来计算各个
品种内和品种间的遗传距离,也得到了类似的结论。
氟烷基因PCR产物序列中445~579为外显子部分,仅仅发现同义突变。将所
测的序列翻译为氨基酸后,没有发现有氨基酸变异。
关键词:猪、氟烷基因、PCR-RFLP、DNA序列多态性
1前言
stress
猪应激综合症(porcine
hyperthermia
恶性高热(体温骤升至42C~45C)、(mailgant
吸急促、心跳过速、肌肉强直、后肢呈现痉挛性收缩、突然死亡、肉质变劣等征候
PSE肉的产生已给世界各国的养猪生产、销售加工造成了巨大损失。
基因或兰尼定受体基因(rynodine
肉品质的一个主效基因,国内外学者对其作了深入细致的研究。
1.1氟烷基因的作用机理
A
了应激综合症发源地可能在肌肉组织细胞内。
Knudson(1990)发现,骨骼肌的兰尼定受体(Rynodine
白酶消化后,正常猪与应激猪的带型不同,表明正常猪与应激猪之间的氨基酸发生
变,其中只有一处碱基改变导致了氨基酸改变,即兰尼定受体eDNA中的CⅢ3突变
和功能的改变。这种改变导致应激状态下ca2+大量非正常释放,引起电解质代谢紊
乱,出现肌肉持续收缩,使猪产生恶性高热。大量析出的ca2+激活过量的糖元酵解,
使肌糖元酵解过程加速,引起肌肉pH值的异常变化,导致劣质猪肉(PSE肉)发生。
1.2氟烷基因连锁群
根据已有资料分析,氟烷基因连锁群主要包括:磷酸已糖异构酶(PHl8)、H一
(6一PGD“)基因(Archibald,A
L.Imlah,E1985;Archibald,A
L.1991;Aehibald.
et
AL,1989;Zeveren,Avon
a1.1988a;1988b;1988c;1988d;Muller,Selal.1989)。综
合了已报道的资料,氟烷基因连锁群定位及其座位顺序见图1。
5
A/O血型(S5)……·-Hal“~…-PHIB一…~(H8)……一P
o.2~一..6.PGDA
固l氟烷基因连锁群的遗传图
1.3氟烷基因定位
以氟烷基因c£lNA部分片段为探针,运用原位杂交技术,已将人及部分动物的氟
etal,
1991;1990)。
图2猪氟烷基因座位及其连锁群的染色体定位
表1氟烷基因定位表
物种
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