猪fscn1和af7基因的生物学特征研究.pdf

摘要 本论文分为两部分，第一部分为猪FSCNI基因的SNP检测与性状关联分析，第二部分为猪 TAFT基因的克隆、染色体定位和组织表达分析。 第一部分：猪FSCNl基因结构、SNP检测及性状关联分析。不同猪品种之间在生长、胴体 和肉质性状等方面存在很大差异。从遗传角度来讲，这些表型差异在很大程度上是由骨骼肌生长 发育过程中基因的表达差异决定的。我们实验室利用L0ngSAGE技术进行中外两个猪品种不同 发育时期的胚胎骨骼肌比较转录谱研究，筛选出差异表达新基因FSCNl。该基因在猪胚胎发育 33天、65天和90天的骨骼肌中均有一定量表达，以通城猪90天和长白猪65天为表达最高点。 蛋白结合蛋白，通过参与肌动蛋白的聚合与解聚过程，从而对细胞黏附、细胞迁移和细胞间相互 作用产生重要影响。然而，猪FSCNl基因结构和生物学功能一无所知，因此，我们开始对该基 因的生物学特征做初步的研究。 首先，我们克隆到猪FSCNI基冈全长(8843bp)，并对该基因结构进行分析，发现该基因包 含5个外显子和4个内含子，这与人和鼠的FSCNI基因结构一致。然后，我们检测到了该基因 一步的研究，在9个猪品种间进行基因频率分析，并在实验猪群中进行了基冈多态检测及其性状 关联分析。结果表明：C厂r6840多态位点在三种小型猪(巴马小型猪、五指山小型猪、贵州香猪) 中以偏T型存在。而在其它猪品种中，C和T基因型的分布较为均匀。该多态位点与达上市体重 日龄(the sale， ageuptomarketweght，AGE)、出生至上市日增重(the test ADGl)、测定期日增重(the period，ADG2)、肉质酸度(meatpH， averagedailygainduring MpH)、失水率(water loss，DnpL)几 个性状显著相关；A／G7365多态位点只有在莱芜猪中则该SNP位点以G型为主，而在其它猪群体 中以A型为主。该多态位点与皮厚(skinthick，SKIN)、眼肌高度(10ineye—muscleheight，EH) 和平均血细胞血红蛋白浓度(mean corpuscularhemoglobin 蝴多态位点只有在大白猪中该SNP位点A型和G型分布较为均匀，而其它猪群体中以G型为 ofleanto 主。该多态位点与内脂肪率(ratio 胞血红蛋白浓度、总蛋白(total urea protein，TP)、平均血细胞血红蛋白浓度和血清尿素氮(serum nitrogen，SUN)显著相关。 FactorIID。TFIID)是由TATA框结合蛋白(TATA-binding (TBP．associated 转录机制的启动过程中发挥着中枢作用。TAF是一个成员繁多的蛋白家族，在TFIID复合物中， 不同的TAF因子可以识别特异的启动子结构、存在于特异的细胞周期、参与特异基因的表达。 Ⅻ蛋白是TAF家族中的一个成员，近年来，关于TAF7蛋白的功能及其分子作用机制的研究 越来越多，TAF7通过参与基因转录起始而起到调控许多生物学现象的作用。然而，目前还未发 现有关于猪TAF7基因的报道，我们分析了猪TAFT基因及其编码的蛋白质序列特征、该基因的 染色体精细定位和组织表达特征，希望为猪分子遗传育种提供基础知识，为猪的遗传选育提供分 子标记。 首先，我们以五指山猪为研究对象，克隆到长1701bp的Ⅻ基因序列，其中包括长1050bp 内含子。我们通过网络软件GENSCAN对该基因序列进行简单分析，结果表明TAF7基因编码349 个氨基酸，利用网络软件rpsblast对猪TAF7蛋白进行保守结构域预测，发现其含有人转录因子 个物种的TAFT蛋白序列，并利用MEGA3．1软件构建了不同物种之间TAF7蛋白的系统发育树， 结果表明猪TAFT蛋白序列与人TAF7蛋白序列的相似性较高