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- 2016-02-22 发布于贵州
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猪sla抗原递相关新基因的克隆及功能分析
摘 要
猪SLA-DMB基因和LMP2基因是参与SLAI,II类抗原递呈的两个重要功能
基因,对其进行克隆测序及遗传变异研究,可以为研究猪免疫应答抗原递呈机理和开
展猪抗病育种工作提供基因数据和相关基因多态性信息。本文以人基因eDNA序列为
信息探针,对猪EST数据库进行同源检索筛选,电子克隆猪相关新基因,分析功能
区外显子的遗传变异并预测其蛋白质的结构及功能,旨在根据物种问同源基因序列,
建立一条跨物种电子克隆新基因的有效途径。研究结果如下:
lSLA.DMB基因的克隆及分析
服务器对所获得的eDNA序列进行开放阅读框架(Om0分析,结果发现其开放阅读框
架推测编码263个氨基酸。为了验证电子克隆序列的正确性,在其起始密码子区域和
终止密码区域设计特异引物,经RT-PCR进行克隆、序列分析验证,结果表明与电子
化分析,发现克隆到的序列与其他物种DMB基因具有很高的同源性。应用生物信息
学的方法对SLA-DMB基因编码氨基酸进行蛋白质基本性质,结构及功能预测,结果
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