水稻分子图谱的建和qtl定位研究.pdf

摘 要 群体为作图群体，构建了～’张水稻SSR连锁图，定位了一些新的SSR标记，并采用区 问作图法对水稻分蘖数、株高、抽穗期、齐穗期、结实率、千粒重等18个重要农艺性 状进行了QTL定位分析，获得了以下主要结果： 记的遗传连锁图谱，覆盖水稻基因组1602．5cM，标记间平均距离17．23cM。 2、在该图谱上定位了48个本实验室开发的SSR标记，分别定位在第1、2、3、4、 数、株高、有效穗数、剑叶长、穗着粒数、实粒数、结实率、粒重、穗着粒密度、粒长、 粒宽、粒厚，以及谷粒长宽比等14个性状在2个亲本之间都存在较大差异；分蘖率、 抽穗期、齐穗期及穗长等4个性状在双亲之间差异不明显，但在F2群体中存在明显分 离。多数性状在群体中都呈连续的正态分布，各个性状之问存在着极其复杂的相关关系。 4、利用由PA64S×NIPP构建的分子连锁图谱，运用区间作图法对水稻的农艺性状 避行了2年2点的QTL定位分析。在F2群体中共检测了18个性状，其中有14个性状 检测到28个QTLs，分布在9条染色体的15个区间，没有检测到抽穗期、齐穗期、穗 分布在8条染色体的9个区问，仍然没有检测到控制抽穗期和齐穗期的QTLs。在这35 过20％)，属主效基斛，其余27个QTLs的贡献率较小(O一19．9％)，属微效螭凼。 m铆2分别位于5、2、8染色体，贡献率都较小，分别为7．7％、8．1％、6．4％。 贡献率介于8％一57．6％。 —刀，、∥2，分别位于1、12染色体，贡献率分别为6％、55．2％，没有检测到穗长的QTL。 F2 3群体中，在11染色体检测到一个主穗长的QTL～唧r，俐，，贡献率5．6％。F2群体检测 到一个与穗数有关的QTL_7”，，位于第5染色体，贡献率11．3％。 (4)每穗颖花数、每穗实粒数、结实率与穗着粒密度的QTL定位：F2群体检测到 10染色体，贡献率分别为13．4％、5．4％，两者联合可产生5．4％的总变异。 (5)粒重、粒形的QTL定位：1个与粒重有关的QTL—饥，』，位于第5染色体， 贡献率7．5％。1个粒长的QTL—∥J，位于第3染色体，贡献率为0。2个与粒宽有关的 第2、3、5、6、10染色体上，表型贡献率7．8—47．5％。 5、本研究中，F2、F2：3群体的性状考察分别在成都、海南进行，由于两地水稻生长 发育的环境差异较大，亲本及群体各性状表现出较大差异。tnl、eml、∥，在F2．3群体 之中的3个QTLr7^，、ph4、ph5，在F23群体中也被重复检测到。另外，分别在第2、 lO染色体上新检测2个株高的凹Ls—础∽2、肋阳5。 6、对6个与标记间遗传距离为0的QTLs进行了生物信息学分析。结果表明：标记 白质可能具有增加粒数的作用；标记OSR28所在的基因可能具有降低每穗着粒数的作 宵降低穗着粒密度的作用；RM526能分别在同本晴和一条来自于几本晴的mRNA中扩 增出长度为239bp的片段，推测该标记所在区域的基因可能具有增加籽粒宽度、降低分 度为263bp的片段，该片段所属基因可能具有增加分蘖的功能。 此外，本文还对图谱构建、QTL定位的影响因素及QTL的功能解析等问题进行了 讨论。 关键词： 水稻 SSRQTLs遗传图谱 数量性状 水稻基因组 ABSTRACT 1 X descendantsas constructed 80PA64S Using NipponbareF2 mappingpopulation，we riceSSR a ofnewSSR interval map，andpositionedgroup markers．Usingmapping linkage trait 18 traits tiller number, protocol，quantitativeloci(QTLs)withagronomicincluding effectivetiller