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甜橙(citrs sinensis osbeck)红肉突变体类胡萝卜素合成相关基因的克隆与特性分析
Osbeck)红肉突变体类胡萝卜素合成相关
甜橙(Citrussinensis
基因的克隆与特性分析
捅要
柑橘红肉突变体果实富含多种对人体有益的类胡萝卜素。这些突变体不仅能为
研究柑橘芽变形成,而且还对研究柑橘果实类胡萝1-素代谢提供素材。本研究以甜
sinensis sinensis
橙红肉突变体红肉脐橙(C Osbeck)和红色暗柳橙(COsbeck)为
实验材料,分析了其果实发育过程中类胡萝I-素变化趋势和相关基因的表达;并构
建了红肉脐橙果肉cDNA文库,开发了部分EST.主要研究结果如下:
1、完善了柑橘成熟果肉的RNA提取方法。发现在RNA提取过程中,先用无水
乙醇去除果肉中的水分,能获得高纯度和高浓度的RNA样品。
2、对红肉脐橙和华盛顿脐橙8-11月份的果实类胡萝卜素总量和组分变化进行了
分析。结果表明:红肉脐橙果实中类胡萝I-素总量、番茄红素和八氢番茄红素比华
盛顿脐橙高。红肉脐橙果肉中伊胡萝卜素含量要高于华盛顿脐橙,但后者果皮a-
胡萝卜素含量比红肉脐橙高.
3、克隆并分析了红肉脐橙与华盛顿脐橙果实发育过程中类胡萝I-素合成途径9
个相关基因。结果表明:
1)红肉脐橙和华盛顿脐橙番茄红素卢环化酶基因(Lcyb)均为单拷贝等位基因,
有2个不同的转录本,这2个转录本之间有差异,但品种间没有差异。mRNA
原位杂交和RT-PCR分析表明,Lcyb表达量随果实成熟上升,但在红肉脐橙
白皮层中没有表达或表达量很低。
2)红肉脐橙和华盛顿脐橙八氢番茄红索合成酶基因(Psy)均为2个拷贝,两
者推导的氮基酸只有1个残基的差异。其表达量随着果实成熟而上升,但红
肉脐橙白皮层中Psy基因的表达量要比华盛顿脐橙高。
3)红肉脐橙和华盛顿脐橙番茄红素8环化酶基因(Lcye)为单拷贝基因。在果
实发育过程中均发生了选择性剪接,形成两个转录本,其中一个转录本缺失
14bp产生终止突变。包含缺失区的DNA含有2个6bp的正向重复。
等另外6个基因在红肉脐橙和华盛顿脐橙果实发育过程中均有表达,但番茄
红素上游基因表达量要比下游基因高。对这6个基因的拷贝数分析表明,红
肉脐橙和华盛顿脐橙没有差异.
4,采用cDNA-AFLP研究了红肉脐橙和华盛顿脐橙果实发育过程中差异表达基
因。通过120对引物组合扩增,获得了1个在红肉脐橙果肉中增强表达的片断,并
V
个氨基酸,可能参与调节柑橘果实发育。
5、以12个甜橙品种为材料,采用同源序列法克隆了copia类反转录转座予的反
转录酶(RT)区域。序列分析表明,除梦脐橙和哈姆林甜橙一样外,其余的10个
RT序列高度异质。产生这种异质性的原因主要有移码、缺失、碱基替换、终止突
和Northern杂交没有发现copia类反转录转座予在红肉脐橙和清家脐橙果实和叶片
发育过程中的转录活性。
6、克隆了红色暗柳橙和暗柳橙Lcyb
DNA全长(分别命名为HAVL毋,b和
II
llHpa
CRED—RA分析得到了1个可能发生DNA脱甲基化的位点,该位点与反转录转座子
有关。
7、以红肉脐橙不同发育时期果肉为材料,构建了一个eDNA文库。原始文库包
含有约5.086X105个克隆,重组率为94%,插入片段大小分布在400-2000
bp,平
均大小为900
bp左右。选取300个克隆进行了EST分析,获得了289个高质量的
EST。其中有125个EST与其他物种相应基因的氨基酸序列同源性大于50%;去除
重复EST后,获得了86个单一
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