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一粒系小麦高分量谷蛋白亚基1ay的分布及其编码基因的结构特点
四川农业大学硕士论文
一粒系小麦高分子量谷蛋白亚基1Ay的
分布及其编码基因的结构特点
研究生:胡喜贵
指导教师:伍碧华研究员
摘 要
(Triticum
urartu)、野生一粒小麦(zboeoticum)和栽培一粒小麦(zmonoeoccum)。
作为多倍体小麦A染色体组的供体物种,一粒系小麦一直被认为是改良小麦的重要
基因资源。已有研究表明,一粒系小麦存在普通小麦中根本不表达的1Ay亚基。本研
究通过对44份一粒系小麦lAy的分布及其编码基因进行克隆、测序、结构分析、原
核表达,以及序列比对,获得主要结果如下:
1. 一粒系小麦的高分子量谷蛋白lay亚基多样性
遍存在lAy亚基的表达。供试的乌拉尔图小麦、野生一粒小麦和栽培一粒小麦的分
显的多态性。3种供试物种中分离出齐平于和快于1Dyl2,齐平、快于和慢于1Bx7,
基附近,而野生一粒小麦和栽培一粒则以集中在1Bx7附近为主。尽管一粒系小麦lay
的表达与地理来源有关,但也存在变异,体现在来源地不同的同一物种的lay表达
频率相异,又体现在来自同一地区材料的lay迁移率存在明显的多态性。
2. 乌拉尔图小麦lAy的一级结构
利用一对扩增高分子量谷蛋白亚基引物,对1份乌拉尔图小麦材料(P1428281)
的基因组DNA进行PCR扩增得到一条长度大约1.8kb的片段。扩增产物克隆到
PMDl8一T载体中,经梯度亚克隆测序拼接。序列分析表明,该片段为lay亚基编码
四川农业大学硕士论文
基因。GenBank登录号为:FJ404595。
TGATAG结束,编码608个氨基酸残基。推导的氨基酸序列具有典型y.型高分子量
谷蛋白亚基的结构特征,由21个氨基酸残基的信号肽,104个氨基酸残基的N.端保
个Cys)四部分组成。其重复区多肽类型较为丰富,高达65个,包括十二肽、十一
肽、九肽、六肽、三肽,以及少见的五肽类型。其中,六肽高达69.23%。
进一步分析发现,lay的编码序列含有很多稀有密码子,均为单个稀有密码。其
Pro密码子最少,仅8.00%(2/25)。所有稀有密码子彼此间隔地单个存在于整个编
码序列中。
3.1ay基因推导氨基酸序列预测的二级结构
通过PSIPRED对克隆的-砂基因推导的氨基酸序列进行二级结构预测,结果显
示,·在信号肽、N-末端和C.末端都有0【一螺旋结构,p一折叠结构仅出现在信号肽和N-
末端,重复区全为无规则卷曲结构。
4.1ay基因的体外表达
设计一对不含信号肽编码区的表达引物,从整合有上述lay的质粒PMDl8-T中
外表达的蛋白与种子中的HMW-GS迁移率基本一致。
5.乌拉尔图小麦lAy亚基与其它HMW-GS的关系
5.1成熟蛋白氨基酸组成
通过对乌拉尔图小麦的]Ay与来自不同物种的9个y.型HMW-GS的成熟蛋白氨
基酸组成比较显示,lay具有v.型亚基氨基酸组成的共同特性,比如,其含量最高的
率的六肽PGQGQQ中,是氨基酸序列的主要成分。该三种氨基酸的总含量与其它Y一
四川农业大学硕士论文
型亚基相近(60.00
m01%)。
5.2聚类分析
以大麦D.hordein作为外类群,对本研究所克隆的1Ay亚基与来自小麦属四倍体、
六倍体和山羊草属以及黑麦属的7个X.和9个y-型亚基的N端+C端氨基酸序列及
全氨基酸序列进行序列比对,两种分析呈现出一致的聚类结果,均首先分为x.型和
y.型两个大类。lay亚基以80%以上的可靠度与Ny亚基聚在一起,说明来自一粒系
小麦的lAy与来自单芒山羊草(Aegilops
相似性。
关键词:一粒系小麦;高分子量谷蛋白亚基;lAy;迁移率;分布;分子克隆;序列
分析;原核表达
四川农业大学硕士论文
ofHMW—-GSandtheStructure
Distribution lAy
ofthe GeneinEinkornWheat
Character
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