水稻抗旱数量性位点（qtls）的基因挖掘研究.pdfVIP

摘要 | ／水稻是世界上最主要的粮食作物之一，T旱同其他环境胁迫一样．是影响作 一 、。，p一 物产量的重要制约冈素。7水稻的抗旱性?状是由多基因控制的数量性状．只前对抗 ／j■■E；：。。一 早性状的遗传改良主要集中在对抗旱数量基冈位点的研究，通过小同的生理机理 或在小同的环境条件下多基冈的祟加效麻来表现抗旱性。 为了寻找抗旱数量性状位点的潜在基冈，我们选用Azucena和1R64的重组近 交系，分别对产量性状和在胁迫与非胁迫的环境条件下进行大田实验。研究表明． 这个群体的分离主要是由于在半矮杆基冈(sdl)两侧区域的等位基冈的变异0f起， 同时这个区段也是引起产量变异的重要位点。 为了对这一区段进行进一步的研究，我们发展了一个生物信息学的程序 (IRlSNP)，利用公布的两套水稻基冈组序列一国际水稻基冈组测序中心测序的 比对来寻找基冈中的SNPs。奉沦文以水稻半矮杆基冈区域的候选基冈为例，详 细描述了建立IRISNP数据库、SNPs发现的程序、互联酬查询界面和SNPs搜寻结 果输出的整个过程。 ／ ／研究结果表明，有175个基冈位于1号染色体上半矮杆基冈两侧的区域 冈，23为伪基冈，24个未知功能的蛋白但有表达序列标签(EST)匹配的基冈，80 个为假蛋白的基因。另外，在已知功能的基因中深入研究发现有161-基冈与抗旱 、 有紧密相关。人足／＼ 关键词：水稻基因组；基冈挖掘：单核苷酸多态性；候选基冈， Abstract for of Riceisan food millions Drought，like importantstaple peopleglobally otherenvironmental for stresses，limits improvement yield．Genetic many crop natureofthe inricemustdealwiththe trait， stresstolerance quantitative drought theadditiveeffectsofseveral loci the whichreflects geneticthroughoutgenome．each the a ot’ a modestcontributiontowards variety making phenotype，through in environments different conditionally mechanisms，perhaps physiological facilitatethe ofthecandidaterice To discovery