云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NS基因进化分析.pdfVIP

中华流行病学杂志2013年5月第34卷第5期ChinJ 2013，V01．34，No．5 ·491· Epidemiol，May ·实验室研究· 1亚型病毒 云南边境地区禽流感H5N NS基因进化分析 肖雪 张文东段博芳赵焕云 刘庆亮 胡挺松邱薇 冯子良郑颖 范泉水张应国 张富强 【摘要】 目的 阐明云南边境地区禽流感H5N1亚型病毒NSl、NS2基因变异特征及遗传进 化关系。方法在云南边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品，经H5N1亚型特异性多重 RT-PCR检测，阳性样品对病毒NS基因进行扩增，克隆Z至pMDl8一T载体测序，获得NSl、NS2基因 序列，并与已知参考毒株序列进行序列比对及系统发育分析。结果 自1240份样品中检出H5N] 亚型阳性样品71份，阳性率为5．72％；30份代表性阳性样品病毒NS基因测序获得17种序列，存在 3个不同进化(亚)分支(I一1、I一2、Ⅱ)；NSl／NS2基因与病毒血凝素(HA)基因呈现不同进化关 系；NSl蛋白涉及核定位信号区、RNA结合区、效应区及其他致病性相关的关键性氨基酸位点存 在替代或突变。结论云南边境地区H5N1亚型病毒NSl／NS2基因具有遗传差异，2010年以来 NS基因进化分支I一2、Ⅱ已成为当地流行的优势毒株。 【关键词】禽流感病毒；H5N1亚型；非结构蛋白l；非结构蛋白2或核输出蛋白；遗传分析 influenzaH5；N1virusesisolatedfromthe Geneticevolutionofnon．structural avian geneamong boundaryofYunnanprovinceXlAOXue。2，ZHANGWen—clon毒，DUANBo一釉n毒，ZHAOHuan-yunI， LIU We#，FENG Qing-liang。2，HUTing-son93，QIUZi—lian93，zHENGYin95．FANQuan-shuis，zHANG Yunnan Yunnan 650223，China；2 Ying-gu02．ZHAⅣG凡一qian93．1AgricultureUniversity，Kunming Centre Pr∞incialCentreAnimalDiseaseControlandPrevention；3 for for ChengduMilitaryRegional DiseaseControlandPr鲫ention Thisworkwas omtheScienceand inYunnanProvince supportedbygrants TechnologyProjects author：ZHANG l Corresponding Fu—qiang，Email：zfq968@yahoo．com．cn Toelucidatethecharacteristicsofvariationandthe evolution 【Abstract】0bjective genetic ofnon．structural relatedtoavianinfluenza H5Nlvirusesisolated protein(NSl．NS2)genes subtype fromthe