浙江省1999—2011年麻疹流行株全基因组序列分析.pdfVIP

!!兰堕仃瘴兰墨!查!11119J|莲!!堂塑!塑Chin～JEpidemiol,Sep‘。竺!竺型!!，型-33竺兰 ·实验室研究· 浙江省1999--201 1年麻疹流行株 全基因组序列分析 金青青冯燕徐昌平卢亦愚钟淑玲莫世华 【摘要】 目的从全基刚缉层面探讨浙汀省1999—2011年麻疹病毒的变异及其与疫苗株 S191之删的差异。方法选取浙江省不同年份分离的麻疹病毒流行株9株，采用RT_PCR方法扩 增全基Ⅲ组序列．并与疫苗株S191及国外主西流行基因型毒株进行全序列比较分析。结果 1999--2011年浙江麻疹流行株间的氨基酸同源性为9877％～9989％，麻疹病毒尚未受到明显的 正向压力，各基幽的变异仍属随机漂移．．与疫苗株S191相比，两者问氨基酸的同源性仅为 9663％一9816％，分别存在135～1 59个氨基酸的歧变，其中共同的氨基酸变异位点113个，廿致5 个糖某化位点的变异。，在核苷酸水甲上，N基因的平均变异率最大(55％)；而在氨基酸水平E，P 蛋白的平均变异率最大(77％)。此外，住牟基因组序列上，浙江流行株与各国疫苗株的遗传距离 76，P0．05；f=1239，PO05)。 均大于D…B基因型流行株与各国疫茼组的遗传距离(f一9 结论浙江麻疹流行株与疫曲株S191在各基因L均产生了较大的差异，现行疫苗株与H基凶型 流行株之间的差异远大于疫苗株与国外优势流行株(D。、R，荩幽犁)之间的差异，应密切关注这一 变化趋势，及早研究后备麻疹免疫株一 【关键词】麻疹病毒；全基W组二疫茼；变异 onthe ofmeaslesviruses in 1999to Study sequence circulated genome Zhejiangprovinceduring 2011J1N ya,z2，XU Shi—hua2 Qing—qing‘。FENGChang-pin91，LUYi—yu=．ZHONGShu—lin92。MO l MedieafSchoof l／niversit,．3／ingbo ofAingbo and ControlPrevetllion author：LU coin．cn CorrespondingYi—vu，Email：loyiyuzjh@yahoo This theNationalNaturalScienceFoundation(N．the yJork∽∞supportedbygra眦sho,n Scienceand Province(No2009C0301l—4)and Technology肿矿PrD坤c☆ofZhejiang Zh4iang Prc,viacialNaturalScie埘eFoundation(NoY2091178) To the variationsbetweenmeaslesvaccinestrainS191 【Abstract】0bjecfivestudygenetic andstrainsthatcirculatedin the 1 999to20儿Methods Zhejtangprovincecausingepidemicsduring ofthenine measlesstrainswere bvRT_PCRProducts Completesequence Zhejiang amplified assay