鸡下丘脑高丰度miR-101的组织表达谱与功能预测分析.pdfVIP

中国农业科学 2013,46(6): 1247-1255 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.06.019 鸡下丘脑高丰度miR-101 的组织表达谱与功能预测分析 李国喜, 王乐乐, 孙桂荣, 康相涛 （河南农业大学牧医工程学院/河南省家禽种质资源创新工程研究中心，郑州 450002 ） 摘要： 【目的】全面了解鸡下丘脑高丰度 miR-101 的组织表达情况和潜在生物学功能，为揭示下丘脑调控 鸡机体能量平衡的分子机制奠定基础。【方法】采用茎-环定量RT-PCR 方法检测miR-101 在固始鸡4 个发育阶段、 13 种组织中的表达，利用Pictar 算法预测miR-101 的靶基因并对预测靶基因分别进行Gene Ontology 分析、通 路分析和分层富集。【结果】 miR-101 的表达具有明显的时序特征和组织特异性，胚胎期各组织中的表达水平明 显高于出壳后，脑部各组织中的表达水平明显高于其它被检测的组织，并在14 胚龄下丘脑以及 17 胚龄小肠和腿 肌中高丰度富集；miR-101 的预测靶基因在生物学调节、代谢过程、发育过程和细胞过程等基本生物学过程中显 著富集；针对神经系统发育的生物信息学分析显示，miR-101 调控功能主要涉及脑发育、神经元分化、神经发生 调节、神经胶质细胞分化和星形胶质细胞分化等生物学过程。【结论】 miR-101 为脑部组织高丰度表达miRNA， 在脑发育相关的许多生物学过程中可能发挥重要的调节作用。 关键词： miR-101; 组织表达谱; 靶基因; GO 富集分析; 鸡 Tissue Expression Profile and Bioinformatics Analysis of Abundance miR-101 from the Hypothalamus of Chicken LI Guo-xi, WANG Le-le, SUN Gui-rong, KANG Xiang-tao (College of Livestock Husbandry and Veterinary Engineering, Henan Agricultural University/Henan Innovative Engineering Research Center of Poultry Germ Plasm Resource, Zhengzhou 450002) Abstract: 【Objective 】 The objective of this study is to comprehensively understand the chicken hypothalamus abundance miR-101 expression and potential biological function which will lay a foundation for revealing the molecular mechanisms of hypothalamic regulation of the chicken energy balance. 【Method 】 Stem-loop quantitative RT-PCR was used to detect the miR-101 expression in 13 different tissues of Gu-shi chicken at four developmental stages. The algorithms PicTar was used to predict miR-101 putative target genes. Gene Ontology, pathway and stratified enrichment were analyzed respect