家蚕JAK_STAT信号通路相关基因克隆与分析.pdfVIP

中国农业科学 2012,45(17):3592-3601 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.17.016 家蚕JAK/STAT信号通路相关基因克隆与分析 彭景琨，曹广力，钱 莹，张晓丽，马焕艳，何 蕾，薛仁宇，贡成良 （苏州大学基础医学与生物科学学院，江苏苏州 215123 ） 摘要： 【目的】鉴定家蚕JAK/STAT信号通路组成原件，并预测家蚕JAK/STAT信号通路主要相关基因的功能。 【方法】在电子克隆的基础上，通过 RT-PCR 获得家蚕 JAK/STAT 信号通路的主要相关基因；利用在线软件对相关 蛋白进行结构域分析；基于microarray数据库或qPCR分析各基因的组织表达特征。【结果】克隆了家蚕JAK/STAT 信号通路主要相关基因，包括 BmSTAT、BmHOP、BmSOCS2、BmSOCS5A、BmSOCS5B、BmSOCS6、BmDRK、Bmken、BmPIAS1、 BmPIAS2 以及BmPI3K，但没有能克隆到果蝇Upd1 、Upd2 和Upd3 的同源体基因。序列分析显示BmHOP具CRD_FZ、 Kringle、转膜区域和PKc超家族蛋白激酶催化结构域TyrKc；BmSTAT有 2种亚型，均具 SH2、STAT_bind、STAT_int 和STAT_alpha 结构域；在克隆的 BmSOCS 家族的3个基因中，BmSOCS2A和BmSOCS6A具典型的SH2和SOCS 结构域； BmDRK由SH3 和SH2两种结构域形成了SH3-SH2-SH3串联结构；BmKen存在BTB和锌指结构域，BmPIAS1和BmPIAS2 具有 LCR 结构域，BmPI3K 具有 2 个 SH2 结构域。【结论】成功克隆了家蚕 JAK/STAT 信号通路主要相关基因。相 关蛋白的保守结构域分析显示，在家蚕 JAK/STAT 信号通路中，BmHOP 是 JAK 激酶的一种，可以磷酸化 BmSTAT 转 录因子，激活靶基因转录；BmSOCS、Bmken、BmPIAS1以及BmPIAS2对JAK/STAT通路起负反馈作用。 关键词：家蚕；JAK/STAT通路；基因克隆；序列分析 Cloning and Sequence Analysis of JAK/STAT Pathway Related Major Genes of Silkworm (Bombyx mori) PENG Jing-kun, CAO Guang-li, QIAN Ying, ZHANG Xiao-li, MA Huan-yan, HE Lei, XUE Ren-yu, GONG Cheng-liang (School of Biology Basic Medical Sciences, Soochow University, Suzhou 215123, Jiangsu) Abstract: 【Objective 】The objective of this study is to identify the elements of JAK/STAT pathway of silkworm, Bombyx mori and determine the function of JAK/STAT pathway related major genes in silkworm. 【Method 】JAK/STAT pathway related major genes in silkworm were obtained through electronic cloning and conventional RT-PCR. Domain analysis on the related protein were conducted by using bio-softwar