利用基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建及粒重QTL分析.pdfVIP

中国农业科学 2014,47(24):4769-4779 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.24.001 利用基因芯片技术进行小麦遗传图谱构建及粒重QTL分析 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1,3 陈建省 ，陈广凤 ，李青芳 ，张 晗 ，师翠兰 ，孙彩铃 ，邓志英 ，刘 凯 ，谷植群 ，田纪春 1 2 （山东农业大学农学院小麦品质育种研究室/作物生物学国家重点实验室，山东泰安 271018 ； 山东省农业科学院作物研究所，济南 250100 ） 摘要：【目的】小麦遗传图谱是进行小麦染色体分析和研究表型变异的遗传基础。通过利用传统分子标记和 现代基因芯片技术相结合，构建高密度遗传图谱，重点开展主要产量主要构成要素——粒重的初级基因定位， 确定影响粒重的主效 QTL 位点，为开发粒重 CAPS 分子标记及在分子标记辅助育种提供依据和指导，并为利用小 麦粒重次级群体进行精细定位和基因挖掘奠定基础。【方法】利用 90 K 小麦 SNP 基因芯片、DArt 芯片技术及传 统的分子标记技术，以包含 173 个家系的 RIL 群体（F9：10 重组自交系）为材料，构建高密度遗传图谱，并利用 QTL network2.0 进行了 3 年共 4 环境粒重 QTL 分析。【结果】构建了覆盖小麦 21 条染色体的高密度遗传图谱， 该图谱共含有 6 244 个多态性标记，其中 SNP 标记 6 001 个、DArT 标记 216 个、SSR 标记 27 个，覆盖染色体总 长度 4 875.29 cM，标记间平均距离 0.78 cM。A、B、D 染色体组分别有 2 390、3 386 和 468 个标记，分别占 总标记数的 38.3%、54.3%和 7.5%；3 个染色体组标记间平均距离分别为 0.80、0.75 和 0.80 cM。用该分子遗传 图谱对 4 个环境下粒重进行 QTL 分析，检测到位于 1B、4B、5B、6A 染色体上 9 个加性 QTL，效应值大于 10%的 QTL 位点有 QGW4B-17、QGW4B-5、QGW4B-2、QGW6A-344、QGW6A-137；其中 QGW4B-17 在多个环境下检测到，其贡 献率为 16%—33.3%，可增加粒重效应值 2.30-2.97g，该位点是稳定表达的主效 QTL。9 个 QTL 的加性效应均来 自大粒母本山农 01-35，单个 QTL 位点加性效应可增加千粒重 1.09—2.97 g。【结论】构建的覆盖小麦 21 条染 色体的分子遗传图谱共含有 6 241 个多态性标记，标记间平均距离为 0.77 cM。利用该图谱检测到位于 1B、4B、 5B、6A 染色体上 9 个控制粒重的加性 QTL，其中 QGW4B-17 是稳定表达的主效 QTL 位点，贡献率为 16.5%—33%， 可增加粒重效应值 2.30—2.97 g。 关键词：普通小麦；90K基因芯片；QTL定位；粒重；SNP Construction of Genetic Map Using Genotyping Chips and QTL Analysis of Grain Weight 1 1 1 2 1 1 CHEN Jian-sheng , CHEN Guang-feng , LI Qing-fang ,