小麦TaDREB1基因的单核苷酸多态性分析.pdfVIP

中国农业科学 2005, 38(12):2387-2394 Scientia Agricultura Sinica 小麦 TaDREB1 基因的单核苷酸多态性分析 1,2 1 2 1,2 １ 陈吉宝 ，景蕊莲 ，员海燕 ，卫 波 ，昌小平 1 （中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点实验室，北京 100081 ； 2 西北农林科技大学农学院，杨凌 712100 ） 摘要：TaDREB1是一种转录因子，调控抗旱等抗逆相关基因的表达。以抗旱性不同的20份六倍体小麦和3份 小麦的二倍体近缘种为材料，用直接测序法筛查 TaDREB1基因DNA序列的单核苷酸多态性，在23份材料的38 038bp 序列中发现了271个SNP 和14 个InDel，平均 140 bp中有1 个SNP，2 717 bp中有1 个InDel。核苷酸多样性 （Л） 分析表明，小麦二倍体近缘种的Л值（0.02188）明显大于六倍体小麦的Л值（0.01029），说明该基因在二倍体 种中的变异程度大于六倍体小麦，可能原因是六倍体小麦长期承受强大的人工选择压力。单倍型分析揭示了 TaDREB1 基因单核苷酸多态性与抗旱性表型的相关性，但同时也发现在个别单倍型里既有抗旱型材料又有对水分 比较敏感的材料，揭示了抗旱性的复杂性，说明仅用 TaDREB1 基因的单核苷酸多态性还不能完全解释抗旱性复杂 的表现型。 关键词：小麦；TaDREB1 基因；单核苷酸多态性；核苷酸多样性；抗旱性；单倍型 Single Nucleotide Polymorphism of TaDREB1 Gene in Wheat Germplasm 1, 2 1 2 1, 2 1 CHEN Ji-bao , JING Rui-lian , YUAN Hai-yan , WEI Bo , CHANG Xiao-ping 1 （ National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement / Key Laboratory of Crop Germplasm and Biotechnology, Ministry of Agriculture / Institute of Crop Sciences, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100081; 2 College of Agronomy, Northwest Sci-Tech University of Agriculture and Forestry, Yangling 712100 ） Abstract: TaDREB1 is a key transcription factor controlling abiotic-stress-responsive gene expression. Twenty hexaploid cultivars and three diploid species of wheat relative were used to detect single nucleotide polymorphisms (SNPs) in TaDREB1 gene based on sequencing. A total of 271 SNPs and 14 InDels