小麦与条锈菌非亲和互作的cDNA文库构建及表达序列标签分析.pdfVIP

小麦与条锈菌非亲和互作的cDNA文库构建及表达序列标签分析.pdf

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中国农业科学 2008,41(10):3376-3381 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2008.10.061 小麦与条锈菌非亲和互作的cDNA文库构建 及表达序列标签分析 1 1 1 1 1 2 1 1,2 王艳飞 ,屈志鹏 ,张永红 ,马金彪 ,郭 军 ,韩青梅 ,黄丽丽 ,康振生 1 2 (西北农林科技大学植物保护学院,陕西杨凌 712100 ; 西北农林科技大学陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌 712100 ) 摘要: 【目的】了解小麦受条锈菌诱导后的基因表达情况,从分子水平揭示寄主与病原菌非亲和互作机理。 【方法】以小麦品种水源 11 和条锈菌 CY23 号小种组成的非亲和组合为材料,利用 SMART 技术构建条锈菌诱导的 小麦叶片cDNA 文库。随机挑取克隆测序,对其中获得的507条高质量表达序列标签(EST)进行生物信息学分析。 6 -1 9 -1 【结果】得到原始文库的滴度为 1.2×10 pfu·ml ,扩增文库滴度 2×10 pfu·ml ,重组率 97%,插入片段大小为 0.4~3 kb。对获得的 237 个非重复序列进行 BLAST 分析,已知功能基因大部分与能量代谢、蛋白质合成修饰及 加工、转运、信号转导、防卫反应等相关。【结论】该cDNA文库质量较高,信息丰富,获得的已知功能基因中能 量和代谢相关约占 40% ,抗病与防御相关约占 17.1%,这些信息有利于在分子水平上研究小麦与条锈菌互作机制, 为进一步克隆小麦与条锈菌互作中的相关重要基因及功能分析奠定基础。 关键词:小麦;条锈菌;cDNA文库;表达序列标签(EST) Construction of a cDNA Library and Analysis of Expressed Sequence Tags in Association with the Incompatible Interaction Between Wheat and Puccinia striiformis 1 1 1 1 1 2 WANG Yan-fei , QU Zhi-peng , ZHANG Yong-hong , MA Jin-biao , GUO Jun , HAN Qing-mei , HUANG Li-li1, KANG Zhen-sheng1,2 (1 College of Plant Protection, Northwest Agricultural and Forestry University, Yangling 712100, Shaanxi; 2Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture, Northwest Agricult

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