中华蜜蜂转录组序及雌性蜜蜂基因表达分析.pdfVIP

摘要 摘 要 本研究以中华蜜蜂(彳矽括ceranacerana)为材料，通过转录组测序技术获得了中 Profile，DGE) 华蜜蜂的转录组信息，并通过数字基因表达谱(DigitalGgeneExpression 测序分析比较了中华蜜蜂蜂王和工蜂的基因表达差异。另外克隆了中华蜜蜂DNA甲 基化转移酶3(DNA 通过转录组测序技术，获得了51，581，510条cleanreads对应4．64Gb核苷酸。这 些reads组装成46，999个Unigene，平均长度676 被注释。将获得的转录组数据作为参考数据库，用DGE方法分析比较中华蜜蜂蜂王 测到414个基因有差异表达，蜂王与工蜂相比，其中189个是上调，225个是下调。 结果显示这些基因的qRT．PCR结果与DGE数据相符合。 bD，编码758个氨基酸残基，预测的蛋白分子量为88．24kD，等电点为7．85。经氨基 Dnmt3有99％的同源性。该基因在工蜂和蜂 酸序列比对，与西方蜜蜂Apismellifera 王不同发育时期均有表达，1日龄工蜂与7日龄工蜂中没有显著差异p0．05)，30日 龄工蜂中的表达量显著高于1日龄与7日龄工蜂俨0．05)；蜂王蛹中的表达量显著高 工及蜜蜂卵巢发育有关。 关键词：中华蜜蜂；转录组测序；数字基因表达谱测序；Dnmt3表达分析 Abstract Abstract Withthe ceranaceranaasmaterialsinthis obtainedthe Apis study，we transcriptome informationofA．ceranacerana and difference byRNA-seqcomparedgeneexpression between andworkersofA．ceranacerana queens bydigitalgene and oftheA．ceranaceranaDNA additon，cDNA analysis．In cloningexpressionanalysis were methyltransferase3(Dnmt3)geneperformed． illuminaRNA weobtained5 10cleanreads Usinghigh-throughputsequencing 1,581，5 to4．64Gbtotalnucleotides．Thesereadswereassembledinto46999 corresponding amean of676 on search thefive similarity uniques、砘t11length bp．Basedsequence against acut-OffE-valueof1 publicdatabases(NR,Swissport，GO，COG，KEGG)witll0。using of were these dataas total Blastx，a