Microbial community structure and nitrogenase gene diversity of sediment from a deep-sea hydrothermal vent field on the Southwest Indian Ridge.pdfVIP

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2016-02-28 发布于天津
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Microbial community structure and nitrogenase gene diversity of sediment from a deep-sea hydrothermal vent field on the Southwest Indian Ridge.pdf

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Acta0ceano1．Sin．，2014，VbI．33，No．10，P94—104 DOI：1O．1007／s13131-014—0544-0 http：／／www．hyxb．org．cn E—mail：hyxbe@263．net Microbialcommunitystructureandnitrogenasegenediversiyt ofsedimentfrom adeep．seahydrothermalventfieldonthe SouthwestIndina Ridge WUYuehong1~，CAOyi2~，WANGChunshengI，WU Min3，AHARONOren4,5，XUXuewei1 LaboratoryofMarineEcosystem andBiogeochem istry,SecondInstituteofOceanography,StateOceanic Administration，Hangzhou310012，China StateKeyLaboratory ofMicrobialResources，InstituteofM icrobiology,ChineseAcademyofSciences， Beijing100101，China 0CollegeofLifeSciences，ZhejiangUniversity,Hangzhou310058，China DepartmentofPlantandEnvironmentalSciences，theAlexanderSilbermanInstituteofLifeSciences，The Hebrew UniversityofJerusalem，Jerusalem 91904，Israel TheHebrew UniversiytofJerusalem．TheEdmondJ．SafraCampus，GivatRam，Jerusalem 91904，Israel Received25March2013；accepted2November2013 ~TheChineseSocietyofOceanographyandSpringer-VerlagBerlinHeidelberg2014 Abstract Asedimentsamplewascollectedfrom adeep—seahydrothermalventfieldlocatedatadepthof2951m on theSouthwestIndianRidge．Phylogeneticanalyseswereperformedontheprokaryoticcommunityusing polymerasechainreaction (PCR)amplificationofthe16SrRNAandnf艘 genes．WithintheArchaea，the dominantcloneswerefrom marinebenthicgroupE (MBGE)andmarinegroupI(MGI)belongingtothe phylaEuryarchaeotaandThaumarchaeota．respectively．Morethanhalfofthebacterialclonesbelonged totheProteobacteria，andmostfellwithintheGammaproteobacteria．Noepsi10npr0te0bacterialsequence wasobserved．Additional phylaweredetectedincludingtheActinobacteria，Bacteroidetes。P nctomycetes． Acidobacteria，Nitrospirae，Chloroflexi，Chlorobi，Chlamvdiae，Verrucomicrobia，andcandidatedivisions 0D1．0P11，W S3andTM6．confirmingtheirexistenceinhydrothermalventenvironments．Thedetectionof n~／ngenesuggeststhatbiologicalnitrogenfixationmayoccurinthehydrothermalventfieldoftheSouth— westIndianRidge．PhylogeneticanalysisindicatedthatonlyClustersIandIIINifH werepresent．Th