兔子朊蛋白结构稳定性的分子动力学研究.pdfVIP

第 23卷 第 6期 化 学 研 究 中国科技核心期刊 2012年 11月 CHEM ICAL RESEARCH hxyj@henu．edu．cn Studyon stabilityofrabbitprionproteinbymolecular dynamicssimulation CHEN Xin，JIN Xiang—feng，LIU Ya—fang，ZHANGJing (CollegeofChemistryandChemicalEngineering，HenanUniversity，Kaifeng475004 Henan，China) Abstract：Prion diseasesareratalandhighly infectiousneurodegenerativediseasesthataffect humansandanimals．RabbitiSoneoftheseveralmammalianspeciesreportedtoberesistantto infectionfrom priondiseases．Inthisresearch，moleculardynamics(MD)andsteeredmolecu— lardynamics (SM D) simulationswerecombinedto studythestability ofrabbitprion protein (rPrPc)．Thedynamicscharacteristicsofthekeysecondarystructuresandtheanisotropicre— sistanceofexterna1forcesofrPrPcwererevealed．Furthermore，the structura1stability of rPrPcwasconfirmedwith structuralconvergenceandrigiditydistributionbasedonthesimula— tions． Keywords：rabbitprionprotein (rPrPc)；structuralstability；moleculardynamics(MD)simu— lation：steeredmoleculardynamics(SMD)simulation CIC number：0643．1 Documentcode：A ArticleID：1008— 1011(2012)06一OO58—06 兔子朊蛋 白结构稳定性的分子动力学研究 陈 欣，金相逢，刘亚芳，张敬来 (河南大学 化学化工学 院，河南 开封 475004) 摘 要：朊蛋 白病是一种能够对人类和动物带来致命影响，并具有高度传染性的神经退行性疾病 ．兔子是 目前 已经报道 的哺乳类动物 中对朊蛋 白病免疫的少数几个物种之一．我们将分子动力学和操控式分子动力学模拟 相结合 ，研究了兔子正常朊蛋白的结构稳定性 ；同时讨论 了蛋 白结构的收敛性及刚性分布 ，并揭示 了兔子朊蛋 白 中关键二级结构的动力学 以及受力各 向异性特征，证实了兔子朊蛋 白结构的稳定性特征． 关键词 ：兔子朊蛋 白；结构稳定性 ；分子动力学模拟 ；操控式分子动力学模拟 Priondiseases，knownastransmissiblespongiform encepha10pathies (TSEs)associatedwith Creu— tzfeldt—Jackobdisease(CJD)，Kuruinhumans，scrapieinsheepandbovinespongiform encepha1opathy (BSE)，arei