中国部分地区2005－2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(5):1805-1812 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.05.038 中国部分地区2005－2007年猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株 ORF5基因和Nsp2基因遗传变异分析 1,2 1 3 2 4 2 2 薛青红 ，张彦明 ，刘湘涛 ，郎洪武 ，邹 敏 ，高金源 ，邓 永 1 2 3 （西北农林科技大学动物医学院，陕西杨凌 712100 ； 中国兽医药品监察所，北京 100081 ； 中国农业科学院兰州兽医研究所，兰州 730046 ； 4 青岛易邦生物工程有限公司，山东青岛 266032 ） 摘要：【目的】为分析 2005－2007 年间中国部分省区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）流行毒株的分子生 物学特征，了解其遗传演化规律，查明中国目前PRRSV 流行毒株现状。【方法】应用病毒分离方法从中国4个省份 在2005－2007 年间采集的81 份疑似蓝耳病病料中分离到36株猪繁殖与呼吸综合征病毒，应用RT-PCR 方法对36 株 PRRSV 现地分离株的 ORF5 基因和 Nsp2 基因进行扩增和序列分析。【结果】36 株现地分离株均属于美洲型 PRRSV，ORF5 基因全长均为 603 bp，未发现有基因缺失或插入，编码约 200 个氨基酸，分离株推导氨基酸序列变 异主要发生在9～39位；36个分离株中有15 株PRRSV Nsp2 基因全长为2 940 bp，21株PRRSV Nsp2基因全长为 2 850 bp；发生Nsp2缺失的 PRRSV在Nsp2 基因第481位、532～560位发生了不连续缺失，共缺失30个氨基酸。 与GeneBank中收录的14个PRRSV ORF5、Nsp2基因进行核苷酸及氨基酸序列比较和分析，系统进化关系显示，除 B02-2005株可能与疫苗株有关外，多数现地分离株与Ch-1a株遗传距离较近，不同年份分离到的毒株与早期PRRSV 分离株的同源性逐年降低。【结论】根据氨基酸变异情况对 PRRSV 现地分离株进行亚群聚类分析，发现 36 株现地 分离株分别归属于以VR-2332为代表的4亚群，以BJ-4为代表的1亚群和以Ch-1a为代表的２亚群。进化关系表 明PRRSV ORF5、Nsp2基因及其推导的氨基酸序列均发生了较大变异，不同地区PRRSV分离株的遗传关系存在交叉 现象，地域特征不明显。 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒；病毒分离；ORF5基因；Nsp2基因；遗传变异 Genetic Variations of ORF5 Gene and Nsp2 Gene of Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Isolates from China in 2005-2007 1,2 1 3 2 4 XUE Qing-hong , ZHANG Yan-ming , LIU Xiang-tao , LANG Hong-wu , ZOU Min , 2 2