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- 2016-03-02 发布于贵州
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山核桃嫁接成活关基因克隆
摘要
摘 要
嫁接是一门园艺技术,其成活过程包含细胞脱分化、再分化等重大理论问题。山
核桃嫁接是公认的难题,为了深入探索这一珍贵物种的嫁接分子机理和调控机制,本
选、分离和生物信息学分析,结果表明:
1.利用改良的CTAB法提取的嫁接样品总RNA质量高、完整性好、无杂质,适
用于eDNA.AFLP分析和荧光定量RT-PCR分析。
PCRcDNA
2.利用SMARTTM
cDNA,完整性好,满足实验要求。
符合技术要求。酶切片段与人工接头连接后进行预扩,获得相当浓度的200~1000bp
的酶切片段拷贝。
4.选用100对选扩引物进行了选择性扩增。改进选扩程序,采用高温(65℃)退火
结合循环降温方法,获得高浓度的特异性产物。
5.用6%聚丙烯酰胺凝胶电泳结合银染对选扩产物进行差异显示,结果共获得300
多条差异表达片段。经切胶回收、纯化和二次克隆等所得差异片段100多条。共测回
来的序列66条,经Blast比序,除去重复序列17条,结果获得了49条TDFs。
6.选取其中12条基因进行定量RT-PCR验证分析,结果显示,其中八个克隆
translationalinitimionfactoreIF-4A,3-5-exoribonuclease/RNA
K1/E32K1 auxin factor1,water
18号未知基因,isolate glycoprotein,putativeresponse
max
channel(PIPlB),Glycine
未知基因,beta
familyG-protein,cdc20
达结果有差异。本实验cDNA.AFLP的表达谱中的75%得到验证。
7.在49条TDFs中,有20个编码已知功能蛋白,8个编码未知功能蛋白,其余
的21个与未注释的基因组序列相似,或者在核苷酸数据库无同源序列。对20个已知
功能的基因进行功能分析,它们分属于物质运输,代谢和能量,细胞周期,信号转导
山核桃嫁接成活相关基因克隆
等9类,说明山核桃嫁接过程中发生了复杂的代谢变化。根据所获得的差异表达基因,
初步绘制了山核桃嫁接调控关系图,从分子水平上证实了现代嫁接的细胞生物学理
论。
异表达研究,并对其加以改进,成功分离到山核桃嫁接成活相关基因。根据这些差异
片段序列制作探针或转化成相应的分子标记,可以为嫁接成活基因的定位、克隆以及
基因表达特性的研究提供理论依据。
关键词:山核桃,嫁接,基因克隆,eDNA.AFLP,定量RT-PCR
Ⅱ
ABSTRACT
ABSTRACT
isa includesthe theoriesinthewhole
Graftinggardeningtechnology,it important surviving
differentiationandSO without
dedifferentiation,cell on.The
process.such勰cell problem improved
and horticulturearcthe tohinderthe of
varietyinability key developmentCarya
step cathayensis
is to themechnasimof orderto themolecul
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