ibv中国分离mrna5及mrna6 5′端独特区基因遗传变异分析.pdf

摘蔓 摘要 infeetiousbronchitis 本研究从我国四川省一疑似鸡传染性支气管炎(Avian virus，IB) BronchitisVirus，1BV) 的雏鸡病料中成功分离到一株鸡传染性支气管炎病毒(Infectious (命名为SC)。病毒经鸡胚传代、血凝实验监测和负染电镜检查，证实为IBV。采用自 行设计的引物经反转录聚合酶链式反应(Reverse-translationpolymerase-chainreaction， 5cDNA(可编码重叠的 RT-PCR)技术扩增得到了sc株、HN株(河南分离株)mRNA 5．06。Clustal 分离株)五株IBVmRNA6cDNA(编码N蛋白)。应用DNAstar 外参考毒株进行序列比较分析和基因同源性分析，绘制了5a、5b和N基因的进化树， 同时描述了核蛋白的抗原表位、疏水性等基本特性。结果如下： 1．对5a基因核苷酸、氮基酸进行了序列同源性和系统进化树分析，结果明：SC、 HN两毒株间有较近的亲缘关系，在同一进化群内，两毒株问5a基因核苷酸和氨基酸的 同源性均较高；两毒株与国内外参考毒株相比存在多处独特的点突变，导致相应区域的 苗株较高，推测5a基因的遗传变异与该疫苗株的应用可能有一定关系。 2．对5b基因核苷酸、氨基酸序列同源性分析表明：在5b基因核苷酸及氨基酸同源 5a基因：对5b基因进化树分析表明，SC株、HN株亲缘关系较近，进化过程中发生的 变异可能相似。 3．从序列同源性、进化树及二级结构预测三个方面分析了相对保守的N基因的遗传 的变异相似；HN、SC、AH三个分离株的变异独特，明显不同于国内外参考毒株，推测 该三个毒株具有共同的起源。但其确切的起源还需要分析最能反映IBV田间进化的s1 毒与宿主、病毒与环境的相互作用等选择压力下进行着不同程度的衍化而在基因的局部 区域具备了各自的特征。 综上所述，本文分析了I-IN、sC两株IBV5a、5b基因和五株IBVN基因的遗传变 基因工程疫苗的下游研究工作提供重要的理论依据。 关键词：[BV；5a、5b及N基因；5，端独特区；遗传变异 m砌呵A5ANDmRNA6AT GE]NETICⅥUUATIoN0F THE REGIONOFIBV 5-UNIQUE ISOLATEDINCH：INA ABSTRACT all Inthis isolatedinfectiousbronchitis study,wesuccessfully SC achickenflockwith clinical ofinfectious isolate)from typical symptom viruswas inchicken SichuanProvinceinChina．The passaged by electron ofmPdqA5 anddetected microscope．eDNA Haemagglutination(HA)exp