中国汉族特发性萎缩侧索硬化全基因组关联分析.pdf

摘要 摘要 目的： 肌萎缩侧索硬化是一种运动神经元变性性疾病，目前发病机制尚不明确， 但遗传因素在发病机制中可能起很大作用。基因组筛查是一种有效寻找易感基 因的方法，前期研究已发现了一些候选基因，但其研究对象多为欧美人群。为 此，我们对中国汉族人群特发性肌萎缩侧索硬化(sALS)进行全基因组扫描，以期 发现新的易感基因。 方法： 收集200名临床确诊中国汉族sALS患者和200健康中国汉族人血样，提取 基因组DNA，每个试验亚组样品DNA等量混合，构建病例组和对照组DNA混 合池，通过全基因组SNP芯片高密度杂交分型，比较分析病例／对照各位点的等 位基因频率差异。找出与sALS相关差异有显著统计学意义的基因位点。 结果： ①经临床资料分析，病例组平均发病年龄(48．5士8．4)岁，40岁以前和80 岁以后发病少见，男女发病比例1．5：l；对照组平均年龄(59．8士11．6)岁，男 女比例1．3：1：②通过质量控制的有基因诠释信息的SNPs位点859311个，无基 因诠释信息的SNPs位点12670个；发现8个新的可疑sALS风险基因位点： 1 1(rS1 INPP5B(kgp5327256)，IQCF5／IQCF 1 1 LOC727878／PFKP(rs9329300)，MYO1)，LO 8B(kgpS08777 ⑨pathway分析发现3个通路可能与sALS相关，共361个基因。 结论： 易感基因位点，3个可能通路，361个候选基因。说明中国汉族人群和欧美人群 的致病基因是有区别的。为今后发现sALS的发病机制及致病基因功能研究进一 步研究提供基础。 关键词：中国汉族；散发性肌萎缩侧索硬化；全基因组关联分析；pathway分析 Abstract ABSTRACT Objective： lateralsclerosisisoneofmotorneuron is diseases，the Amyotrophic pathogenesis not understood factor an roleinthedisease． clearly．Butgeneticmayplayimportant Genome an is effectivetodiscovernew andAmericans screening way gene．Europeans havefindsomeaccoaitedin haveconducteda genes studies．Hence，we prelimnary association ChineseHan discoverwhether genome-widestudy(GWAS)inpeople，to thesearesomedifferentbetween genes ChineseHan and and peopleEuropeans Americans． Methods： Theclini