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— １２— 江苏农业科学　２０１４年第４２卷第１０期 王康宇，王　义，孙春玉，等．ＲＮＡ测序的研究进展［Ｊ］．江苏农业科学，２０１４，４２（１０）：１２－１６． ＲＮＡ测序的研究进展 王康宇，王　义，孙春玉，蒋世翠，张美萍 （吉林农业大学，吉林长春 １３０１１８） 　　摘要：ＲＮＡ测序研究是基因功能及结构研究的基础，能够从整体水平研究基因功能及其结构。随着高通量测序 和定量检测技术的不断发展，能够通过ＲＮＡ测序对转录组进行更深度更完整的研究。该研究进展包括改善转录起始 位点的预测、链特异性测序、融合基因的检测、ｍｉｃｒｏＲＮＡ定量的分析以及 ＲＮＡ可变剪切的识别。目前利用单分子测 序技术可以实现ＲＮＡ的直接测序，通过二代测序技术与单分子测序技术相结合的方式，能更深层次、更全面地获得转 录组信息。 　　关键词：转录组信息；测序；编码ＲＮＡ；非编码ＲＮＡ；高通量测序技术；单分子测序技术 　　中图分类号：Ｑ７５　　文献标志码：Ａ　　文章编号：１００２－１３０２（２０１４）１０－００１２－０５ ［１］ 　　１９９５年Ｖｅｌｃｕｌｅｓｃｕ等首次提出了关于转录组的概念 ， 益兴起，人们利用测序技术研究了从简单模式生物（如酵母、 转录组广义上是指某一特定功能状态下，细胞内所有转录表 拟南芥、水稻等）到人等一些高等物种的基因组中ＤＮＡ修饰 达的基因总和，其中包括编码ＲＮＡ（ｍＲＮＡ）和非编码ＲＮＡ如 和ＲＮＡ的定性定量变化等动态的基因组位点的特性。在对 ｔＲＮＡ、ｒＲＮＡ、ｓｎＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ等，而非编码 ＲＮＡ不能被转录 基因组测序和分析研究的同时，关于复杂的转录组研究也广 识别，不能翻译成蛋白质，但是能参与某些蛋白质翻译过程； 泛发展起来。利用高通量测序技术平台分析转录组的结构和 ［２］ 狭义上是指所有ｍＲＮＡ的总和 。１９９５年第 １个转录组是 表达水平，更能挖掘未知转录本和稀有转录本，精确地识别 由Ｖｅｌｃｕｌｅｓｃｕ等在酿酒酵母细胞中获得的，当时的技术共获 ＲＮＡ的可变剪切以及编码序列的单核苷酸多态性（ＳＰＮ），更 得了６０６３３个转录本，揭示了４６６５个基因，其中有 １９８１个 ［４］ 进一步解析复杂的转录组信息 。 ［１］ 基因是具有已知功能的，其他２６８４个基因尚未被鉴定过 。 最初的转录组研究主要以基因芯片微阵列技术为基础， ［３］ 从人类基因组计划 的实施开始，截至２０１３年 １０月已有６８ 由于基因芯片技术的检测范围取决于芯上的探针信息，所以 种植物和１１９种动物的基因组文章相继发表。高通量测序在 只能检测已知序列的特征，缺少发现新基因的能力，而高通量 过去十几年中快速发展，促使关于生物的功能基因组研究日 测序技术可以很好地弥补基因芯片技术在这方面的不足。因 此，现阶段转录组的研究是借助于高通量的二代ＤＮＡ测序技 收稿日期：２０１３－１２－３１ ［５］ 术（ＮＧＳ） 来完成的，通过构建 ｃＤＮＡ文库并对 ｃＤＮＡ进行 基金项目：国家科技计划农村领域项目（编号：２０１３ＡＡ１０２６０４－３）。 高通量测序，分析测序结果进而解析转录组学中的复杂变化， 作者简介：王康宇（１９８３—），吉林通化人，博士研究生，从事植物功能