molecularmarker分子标记概述.pptVIP

F2群体的特点 F2群体构建比较省时，不需很长时间便可得到一个较大的群体，这是使用F2群体进行遗传作图的最大优点。 F2群体中存在杂合基因型，对于显性标记将无法识别显性纯合基因型和杂合基因型，由于这种基因型信息简并现象的存在，会降低作图的精度。 通过远缘杂交而来的F2分离群体，则远缘杂交亲本后代向两极疯狂分离，标记比例易偏离3：1。 延长F2使用时间的措施 采用无性繁殖，如进行组织培养扩繁、留蔸再生等。 使用F2单株的衍生系（F3株系或F4家系），将衍生系内多个单株混合提取DNA，则能代表原F2单株的DNA组成。从衍生系中选取单株必须是随机的，且株数要足够多。 BC1群体 亲本1 × 亲本2 F1 × 亲本1或2 BC1 BC1群体的特点 BC1群体中每一分离的基因座只有两种基因型，它直接反映了F1代配子的分离比例，因而BC1群体的作图效率是最高的。 由于该群体的配子类型较少，统计及作图分析较为简单，但提供的信息量少于F2群体，且可供作图的材料有限，不能多代使用。 对于一些人工杂交比较困难的植物，BC1群体不太适合用来作图，一是难以建立较大的BC1群体，二是容易出现假杂种，造成作图的误差。 RIL群体 亲本1 × 亲本2 F1 F2 多代自交一粒传 F6或F7 RIL的特点 RIL群体一旦建立，就可以代代繁衍保存，有利于不同实验室的协同研究，而且作图的准确度更高。 异花授粉植物由于存在自交衰退和不结实现象，构建RIL群体比较困难。 建立RIL群体相当费时。 DH群体 亲本1 × 亲本2 F1 花药培养等途径 双单倍体(DH)群体 DH群体的特点 DH植株是纯合的，自交后即产生纯系，因此DH群体能够稳定繁殖，长期使用。 DH群体的遗传结构直接反映了F1配子中基因的分离和重组，因此DH群体与BC1群体一样其作图效率是最高的。 构建DH群体需精湛的花培技术和染色体加倍技术，同时所提供的信息量也明显低于F2群体。 植物的花培能力跟基因型关系较大，因而花培过程会对不同基因型的花粉产生选择效应，从而破坏DH群体的遗传结构，造成严重的偏分离现象，影响到遗传作图的准确性。 中 中 大 大 必要的群体规模 高 高 低 低 准确度 1:1 1:1 1:1 1:2:3或3:1 分离比例 品系 品系 个体 个体 性状研究对象 F2个体自交后代 F1花粉分化个体 F1回交后代 F1自交后代 群体 形成 RIL DH BC1 F2 不同作物群体的特点 * 分子标记及辅助育种技术 分子标记的类型： 第一类是以分子杂交为核心的分子标记技术，包括RFLP、DNA指纹技术等； 第二类是以PCR为核心的分子标记技术，包括RAPD、简单序列重复标记SSR、序标位STS、序列特征化扩增区域SCAR等； 第三类是一些新型的分子标记，如：SNP标记、表达序列标签EST标记等。 分子标记的特点： （1）直接以DNA的形式表现，表现稳定 （2）数量多 （3）多态性高 （4）表现为中性，不影响目标性状的表达； （5）许多标记表现为共显性的特点，能区别 纯合体和杂合体。 （6）成本不太高 RFLP标记 植物基因组DNA上的 碱基替换、插入、缺失 或重复等，造成某种限 制性内切酶酶切位点的 增加或丧失，从而产生 限制性片断长度多态 性。 基 本 步 骤 用DNA限制性内切酶消化 Southern杂交 放射性自显影或酶学检测 DNA提取 凝胶电泳分离，转移到滤膜上 A 无表型效应，不受环境条件和发育阶段的影响。 B 等位基因之间是共显性的，在配制杂交组合时不受杂交方式的影响。 C 在非等位的RFLP标记之间不存在上位效应，因而互不干扰 D RFLP标记起源于基因组DNA的自身变异，在数量上几乎不受限制 E DNA需要量大，检测技术繁杂，难以用于大规模的育种实践中。在植物分子标记辅助育种中需要将RFLP转换成以PCR为基础的标记。 RFLP标记的特点 RAPD标记 RAPD引物扩增电泳检测结果 S104GGAAGTCGCC S105AGTCGTCCCC S106ACGCATCGCA S107CTGCATCGTG S108GAAACACCCC S109TGTAGCTGGG S110CCTACGTCAG S111CTTCCGCAGT S112ACGCGCATGT （1）不需DNA探针，引物设计无须知道序列信息； （2）显性遗传（极少数共显性），不能鉴别杂合子和纯合子； （3）技术简便，不涉及分子杂交和放射性自显影等技术； （4）样品需要量少，引物价格便宜，成本较低； （5）实验重复性较差，结果可