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牙周病基础治疗后龈下菌群动态观察
中文摘要
厂目 的
rDNA片段,
本实验设计通用引物扩增龈下菌斑全细菌16S
通过变性梯度凝胶电泳得到龈下菌群DNA图谱,动态观察龈下细
菌治疗前后在口腔内定植的变化,为牙周病病因学的研究和临床
治疗方案的确定提供实验依据。
方 法
1.标本选择:龈下菌斑取自中国医科大学口腔医学院牙周病
门诊成人牙周炎患者。实验对象选择年龄在30—55周岁之间、探
诊深度3—6毫米、无全身系统疾病、未接受过牙周治疗、近两个月
未服用任何抗生素和甾体类药物者,共26例。
2.治疗随访计划:患者首次就诊,以治疗前牙周状态为基
On
数(BleedingProbing,BOP)、牙齿松动度和牙槽骨吸收度,测
量探诊深度(ProbingDepth,PD);进行全口龈上洁治、龈下刮治、
根面平整,嘱患者口服甲硝唑(200rag,liD)7天。治疗后一周、
一个月和三个月时复查,取龈下菌斑,记录牙周临床指标。
3.标本采集:刮匙法。每个实验对象选取探诊深度在3—
6mm之间的一颗牙齿作为研究对象,龈下刮治器刮取牙周袋的近
中、远中、颊侧牙根面和软组织面各一下,置入含0.5ml无菌PBS
溶液的Eppendorf管中,一70℃深冻冰箱保存。
4.统计学分析:应用SPSSll.0软件分析牙周临床指标在治
疗前后是否有差异及相关性。
5.龈下菌斑DNA的提取及浓度测定:酚一氯仿法提取龈下
菌斑全细菌DNA,溶于60心TE。取5出测量DNA纯度及浓度,
其余置一20%冰箱保存。紫外分光光度仪分别测量260nm和
280nm处吸光度值及比值。比值界于1.7—2.0之间,表示DNA
纯度较好。按公式:DNA浓度(斗g/出)=(AⅫX50×稀释倍数)/
1000,对DNA进行定量分析。
rDNA序
6.PCR扩增:16SrDNA通用引物扩增全细菌16S
列。设计含GC夹的引物,使扩增后的PCR产物在浓度递增的变
性梯度凝跤中始终保持分叉状结构。1%琼脂糖凝胶电泳检测
PCR产物。
7.变性梯度凝胶电泳(DGGE)观察龈下菌群DNA图谱。
7.1垂直DGC-E:制备0~100%垂直变性梯度凝胶,检测最
适解链条件(即变性浓度)。
7.2平行DGGE:根据垂直DGGE检测到的解链区域变性浓
度,制备相应变性范围的平行梯度凝胶。动态观察治疗前后龈下
菌群DNA图谱。
7.3选择特异条带进行切胶、测序分析:选择治疗后减弱、消
失的两个DNA条带和治疗后新出现的两个条带,切胶、回收、克
隆、纯化、测序。
结 果
1.牙周基础治疗前后临床指标的变化
1.1 26例成人牙周炎患者经牙周基础治疗后,临床症状明
显改善,牙周临床指标均有下降。统计学分析表明PII、BOP、PD
和牙齿松动度在治疗前后具有明显差异(P0.01)。牙槽骨吸收
度在治疗前后变化不明显,无统计学意义。龈下全细菌DNA浓度
有下降趋势,这种差异不具有统计学意义。
1.2 Spearman相关分析表明BOP与PD具有重度正相关关
·2·
动度与牙槽骨吸收度和PD呈中重度正相关关系(r=0.630、0.
526,P0.01),随着牙槽骨吸收度和PD的减少,牙齿松动度降
低。 一
2.DGGE图像分析
变性梯度凝胶电泳成功地得到龈下菌群DNA图谱,可动态观
察龈下菌群在基础治疗前后的变化:治疗后一个月DNA图谱变
化明显,新带出现;治疗后三个月与治疗前在一定程度上相似。
3.测序结果
选取治疗前明显、治疗后减弱、消失的两个DNA条带,切胶、
回收、克隆、纯化、测序。测序结果经GenBank的BLAST分析,表
明它们的碱基序列与牙龈卟啉单胞菌(Porphyromona
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