生命起源与演化(通)分析.ppt

基因（gene） 基因组（genome） 基因组学（genomics） 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 分子进化的两层含义 前生命的化学进化阶段（生物分子的起源和进化） 细胞生命出现后，生物分子层次上的进化（主要指生物大分子的进化） 核酸（主要以基因和基因组的形式存在） 蛋白质 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 1. 现代基因组的种类及结构 分析现代基因组的结构是研究基因和基因组的起源与进化的有效途径，即可以从现代基因组的结构来寻找原始基因组结构的“遗迹” 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 1. 现代基因组的种类及结构 现代基因组的种类 类核基因组（nucleoid genome），即原核基因组（prokaryotic genome） 核基因组（nuclear genome），即真核基因组（eukaryotic genome） 细胞器基因组（organelle genome） 线粒体基因组（mitochondrial genome） 叶绿体基因组（chloroplast genome） 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 1. 现代基因组的种类及结构 现代基因组的种类 其他 病毒基因组（virus genome） 质粒DNA（plasmid DNA）， 又称染色体外DNA （extrachromosomal DNA） 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 类核基因组 一般成环状，再形成类核高级结构 基因组通常较小（几百万 bp），基本上由单拷贝或低拷贝（拷贝数少）的DNA序列组成 基因的排列比较紧密，一般以多顺反子为转录单位 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 类核基因组 基因组内较少非编码序列，非编码的重复序列和内含子更少（以前认为类核基因组没有非编码的重复序列，而且原核基因是连续的，即没有内含子。近年在一些细菌的基因组中发现有少量种类各异的重复序列或内含子，但这些非编码的成分只占类核基因组的很小一部分） 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 核基因组 一般是多线状，再形成染色体或间期核的高级结构 通常要比类核基因组大好几个数量级，且变化范围也很大 最大与最小相差数万倍 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 核基因组 在结构组成上，以普遍存在大量的非编码序列为特点 重复序列一般可占基因组的1/3以上，在有些植物中甚至可达90% 内含子也占基因组相当重要的比例，真核基因基本上都是有内含子的断裂基因，一个基因的长度可有多至90% 是内含子 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 核基因组 基因组中的基因分布状况：或成簇分布，或散布在基因组中 绝大部分基因都是处于单拷贝序列的区域 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 线粒体基因组 线粒体在不同类型的真核生物（多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌）中功能相同，但在其基因组的大小和结构上却差别很大 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 线粒体基因组 多细胞动物的线粒体基因组有着相当一致的结构特点 十分细小和致密，大小只有16 kb左右 基因组呈单环状，基因的排列顺序比较稳定，而且也排列得很紧密，没有或很少基因间隔序列，所有基因都没有内含子，基因组中也不存在非编码的重复序列 除了1 ~ 2 kb的序列作为非编码的调控区外，整个基因组都是编码的 多细胞动物线粒体基因组的大小和构型 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 线粒体基因组 高等植物线粒体基因组是各类真核生物线粒体基因组中最大、最复杂的（186 kb ~ 2400 kb），变化也很大 基因组呈单环状、多环状或多线状 基因的排列顺序在不同种类中往往不一样，且基因是散布在基因组上 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 线粒体基因组 高等植物线粒体基因组是各类真核生物线粒体基因组中最大、最复杂的（186 kb ~ 2400 kb），变化也很大 植物线粒体基因组所含的基因可比动物的多两倍左右，但这远远不能说明它们的大小，因此，它们是含有大量的非编码序列，包括基因间隔、重复序列和内含子 高等植物线粒体基因组的大小和构型 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 线粒体基因组 原生动物、藻类和真菌的线粒体基因组在结构上一方面可以说是或偏向于动物型，或偏向于植物型，另一方面又有它们的独特之处 在大小和结构上差异很大，而且在同一类生物中也很不同 总的说来，基因组较小的偏向于动物型，基因组较大的则偏向于植物型 原生动物、藻类和真菌线粒体基因组的大小和构型 现代基因组的种类及结构 现代基因组的结构 叶绿体基因组 比较均一， 85 ~ 292 kb（大部分都在120 ~ 160 kb之内） 特例：伞藻属（Acetabularia），2000 kb