- 1、本文档共127页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
分子标记辅助选择育种use.ppt
当一种分子被放置在电场当中时,它们就会以一定的速度移向适当的电极。这种电泳分子在电场作用下的迁移速度,叫做电泳的迁移率,它同电场的强度和电泳分子本身所携带的净电荷数成正比。 在生理条件下,核酸分子中的磷酸基团,呈离子化状态。DNA和RNA的多核苷酸链则称多聚阴离子(po1yanions)。 DNA分子在碱性环境中带负电荷,在外加电场作用下向正电极的方向迁移。 不同DNA,其分子量大小和构型不同,DNA分子的电泳迁移率就不同,从而可分出不同的区带。 由于在电泳中使用了无反应活性的稳定的支持介质,如琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶等,从而降低了对流运动,故电泳的迁移率是同分子的摩擦系数成反比的。因此根据分子大小、构型或形状所带的净电荷的不同,便可将各种成分分离开来。 1)琼脂糖凝胶电泳 琼脂糖是一种天然聚合长链状分子(线性多糖),从红色海藻琼脂中提取而来的良好的电泳介质,其密度是由琼脂糖的浓度决定的。 化学修饰的低熔点(LMP)琼脂糖,在较低的温度下便会熔化,可用于DNA片段的制备电泳。 制胶: 称取 0.8g琼脂糖 ,加100 ml 1×TAE缓冲液于 三角瓶(1/3),摇匀 微波炉加热溶解,当冷却至60℃(不烫手),加Goodview或EB (终浓度为0.5ug/ml),摇匀 加 0.5×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶2-3cm 竖直向上拔出梳子,将凝胶置于电泳槽中 插入适当的梳子,于室温下冷却凝固 用胶带将制胶板两端封好,倒胶(厚度为4-6mm) 点样: 取PCR产物,每管加3ul含溴酚蓝指示剂的载样缓冲液,混匀后取10ul样品点入加样孔中 电泳: 调电压至3-5V/cm,电泳时间约1-2小时 观察:将凝胶从电泳槽中取出,利用紫外透射分析仪或凝胶成像系统观察,记录结果 注意:凝胶中含有EB(或Goodview),有毒,切勿直接用手接触,废弃胶应集中处理,勿乱扔,不能污染环境; 2)聚丙烯酰胺凝胶电泳 过硫酸胺与TEMED(N、N、N`、N`-四甲基乙二胺)是单体丙烯酰胺的催化剂和诱变剂,它们使单体丙烯胺聚合成长链,长链与长链间就交联成凝胶,链长和交联成决定了凝胶的孔径。 PCR产物每管加入3-4μl载样缓冲液(0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯氰、50%甘油),混匀后用微量进样器取3-4μl注入点样孔 制胶: 称取9.6g尿素,加45ml蒸馏水和8ml 10×TBE,溶解 加12ml 40%丙烯酰胺溶液,搅匀 加入0.8ml 10%过硫酸胺和35μl TEMED,搅匀后立即注入已用琼脂糖凝胶封口的玻璃板中 注满后放平,插入梳子,静置1~2h使胶凝固 点样: 小心拔出梳子,将玻璃板固定在垂直电泳槽上,加入适量的1×TBE电泳缓冲液; 取电泳缓冲液反复冲洗点样孔,清除多余没有凝固的物质; 10×TBE溶液配制:称取108g Tris-HCl、55g硼酸、7.44g EDTA加蒸馏水溶解,定容至1000ml 40%丙烯酰胺溶液配制:称取38g丙烯酰胺、2gN,N’-亚甲基双丙烯酰胺加水 定容至100ml 注意:丙烯酰胺溶液在未凝固前有毒;10%过硫酸胺和TEMED用完后应 置于4℃冰箱中保存。 电泳: 银染: 结果记录: 转入显色液(6g氢氧化钠、0.076g四硼酸钠、1.6ml甲醛,加水定容至400ml)中显色10 min 调电压至300V,电泳时间约3-4h。 将玻璃板从电泳槽上拆下,取出凝胶,在蒸馏水中漂洗2次 转移至0.1% AgNO3溶液中染色10 min;然后将凝胶转移至蒸馏水中漂洗2次; 着色后转入自来水中保存,记录带型结果或凝胶成像 琼脂糖:分辨DNA片段的范围为0.2-50kb之间。 聚丙烯酰胺:分辨范围为1bP-1kb之间。 凝胶浓度:浓度高低影响凝胶介质孔隙的大小,浓度越高,孔隙越小,其分辨能力也就越强;反之,浓度降低,孔隙就增大,其分辨能力也就随之减弱。 例如:20%的聚丙烯酰胺凝胶的分辨力可达l-6bp DNA小片段,而要分离1000bp的DNA片段,则要用3%的聚丙烯酰胺的凝胶。 再如:2%的琼脂糖凝胶可分辨小到300bp的双链DNA分子,而对于较大片段的DNA,则要用低浓度(0.3%-1.0%)的琼脂糖凝胶。 共显性带型: : 1-亲本1的纯合基因型(aa) 2-杂合体(ab) 3-亲本2的纯合基因型(bb) 0-缺资料 显性带型: 4-非亲本1纯合基因型(ab或bb) 5-非亲本2纯合基因型(ab或aa) 1 3 1
文档评论(0)