文昌鱼SMYD家族基因的系统进化分析.pdfVIP

鲁东大学学报 (自然科学版) JournalofLudongUniversity(NaturalScienceEdition) 文 昌鱼 SMYD家族基因的系统进化分析 郭泉阳，李红岩 (中国海洋大学 海洋生命学院，山东 青岛 266003) 摘要：SMYD(SETandMYNDdomaincontaining，SMYD)是一类含有 SET功能域的蛋 白，在染色体的调节、基因 的表达、细胞生长周期的控制、细胞的分裂、分化及发育等方面具有重要作用．目前已知在果蝇、脊椎动物中 均含有Smyd基因，且这些基因的进化 、表达及功能均有很多研究 ，但关于脊索动物 SMYD家族基因的研究则 很少．本文对头索动物文昌鱼的基因组进行搜索，发现文昌鱼有6个可能的Smyd基因．对 Smyd基因在染色 体上的位置分析结果显示 ：文昌鱼Smyd相关基因同其他已经研究过的物种如爪蟾、小鼠、人等一样，均是散 在分布于不同的染色体上．对这些基因的功能域的分析结果显示：文昌鱼的3个 Smyd基因，斑马鱼 的2个 Smyd基因和人的4个Smyd基因除了含有SET功能域之外，还有另外一个 SCOP功能域．基因结构的分析表 明：脊椎动物的基因结构比较保守 ，但无脊椎动物及脊索动物的基因结构则保守性较差．而系统进化分析的 结果则显示 ，文昌鱼Smyd相关的6个基因中只有两个与其他物种同源性较高，其余四个则相对较低．本文旨 在对文昌鱼SMYD家族基因进行初步的系统进化分析，但脊索动物文昌鱼的Smyd基因在体 内到底执行什么 样的功能，其功能又是如何实现的，都有待于进一步研究． 关键词 ：SMYD；进化 ；文 昌鱼 中图分类号：Q349 文献标志码：A 文章编号：1673-8020(2015)04-0325—08 在真核生物 中，组蛋 白不仅是真核细胞染色 指结构域和一个 SET功能域，这两个功能域都和 质包装的基本单位，也在基因表达和调控等方面 染色体重塑有关L1。。。“J，而且SMYD家族基因区别 起重要作用 ¨j．组蛋白修饰已成为转录调控机制 于其他包含 SET基 因的主要特征就是含有 的关键，并可能作为表观遗传标记系统负责建立 MYND功能域 ¨ ．SMYD基因家族的功能都与 和维持细胞分化过程中基因表达遗传程序的有序 组蛋 白甲基转移酶有关，但各 自的功能有所不同． 进行_2-4]．组蛋 白翻译后的修饰包括乙酰化与去 Smydl是心脏和骨骼肌特异的蛋 白质 ，在胚胎发 乙酰化、磷酸化与去磷酸化、甲基化与去 甲基化、 育过程中细胞分化和心肌细胞特化、细胞分化和 泛素化与去泛素化等 J．其中组蛋 白甲基化修饰 细胞成熟的调控 中起到关键性作用 ¨ ．Smydl 酶在组蛋 白的甲基化修饰中的重要作用在多种生 调控组蛋白甲基化修饰，参与转录调控和染色质 物过程如异染色质形成、x染色体失活、转录调控 稳定．Smydl还可以参与蛋白的乙酰化修饰，在转 中，都发挥着重要功能_6J．目前发现的组蛋 白赖 录中起抑制作用 J．Smyd2也与心肌和骨骼肌 氨酸 甲基转移酶中，多数为含有 SET结构域的蛋 的细胞分化和细胞成熟调控有关_2．另有研究表 白质，该家族 基 因分 为很 多类，包 括 EHMT、 明 Smyd2可 与 HSP90a相互 作用，从 而提 高 SETDB、NSD、MLL、PRDM、SMYD 等 引．其 中 Smyd2组蛋白甲基转移酶的活性 ．Smyd3最初 SMYD较为特殊，这类蛋 白因含有 SET结构域和 是在肝细胞癌和结肠癌细胞中发现的，能够调控 一 个嵌入 SET结构域 中的MYND结构域，被称为 癌基因等许多与肿瘤发生发展相关基因的表达， SMYD家族蛋白 ． 增强细胞的增殖和迁移能力 卜川．Smyd3的高表 SMYD基 因家族最早发现