嘌呤核苷相关体系的理论的研究.pdf

摘要 摘要 核苷水解酶是一类以Ca2+为中心金属离子的金属酶，可以有效催化核糖核苷 N．糖苷键的水解获得核糖和碱基。作为病原生物体嘌呤补救途径(puriIlesalvage pa廿1way)的关键酶，近年来在抗寄生虫病药物设计中受到广泛关注，相关领域 的研究已经引起了广泛的兴趣，并取得重要的进展。然而，目前对核苷水解酶与 底物作用的微观机理及其保守残基的作用并不十分清楚。本文选取了与次黄嘌呤 核苷．腺嘌呤核苷．鸟嘌呤核苷水解酶相关的模型体系，对它们的结构特征和相关 化学反应进行了理论计算研究，调查质子化和低能电子附着对N．糖苷键水解性 质的影响。 本文主要获得的主要结果如下： (1)通过核苷水解酶活性中心模型的构建和密度泛函计算，分别研究了中性的次 黄嘌呤核苷和N7．质子化的次黄嘌呤核苷阳离子底物中N．糖苷键解离的势 能面曲线和热力学性质。结果表明，N7．质子化活化了次黄嘌呤核苷阳离子 的碱基离去基团，其能垒要比中性底物体系小得多。 (2)为了探明嘌呤核苷底物的水解性质，对三种嘌呤核苷体系及其N7．质子化的 衍生物结构性质、键解离能、水解机理进行了详细分析。计算结果显示，质 子化嘌呤核苷与中性嘌呤核苷的水解机理并不完全相同，且质子化可以明显 减少N．糖苷键离子解离通道所需要的能量，降低其水解活化能，稳定水解产 物，极大地促进N．糖苷键的水解。 (3)与文献中的低能电子附着DNA脱氧核糖核苷情况相似，嘌呤核苷俘获低能 电子能够改变其平衡构型及电荷分布，显著地降低N．糖苷键的键解离能，影 响嘌呤核苷的稳定性。 关键词：核苷水解酶、N7．质子化、低能电子俘获、N．糖苷键的解离和水解。 AbSIract Abstract Nucleoside a of related hydrolaSescompriSesupe删lystmctIJrally the bondin eIu了Ines，距dnleycatalyze ofN—glycosidic calci啪一dependent hydrolysis t0Ⅱlefi．eeInlcleicb勰eandrit，ose．Nucleosideare ribo肌cleosides，1eading hydrolaSes iIl廿1e of t11at缸Ilsto keyen巧mes purinesalVagepa吐1way protozoa par2Lsitic in meir attractmuchat【ention scaVengep几lrines丘Iomen啊ronments，wmch d11lg remarhblehaVebeen mechalliSticarc design．Altllougll made，也e details prog阳sses stilluncleaLHeresevemlselectcdmodelsofIAG小玎H、vere calculationsonmeirs1飘lctllraI f．eatIll