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第八基因与基因组.ppt
多基因家族(multigene family) 2.3 真核生物基因组 2.核酸序列相同: 多拷贝基因形成的基因簇,rRNA、tRNA、组蛋白基因家族。 组蛋白基因家族 非洲爪蟾的5SRNA基因结构 5SRNA基因 非转录空隔区 多基因家族(multigene family) 2.3 真核生物基因组 3.核酸序列高度同源 生长激素(GH)与绒毛膜生长催乳激素(CS) 氨基酸序列比对 217 多基因家族(multigene family) 2.3 真核生物基因组 3.核酸序列高度同源 多基因家族(multigene family) 2.3 真核生物基因组 4.编码产物的功能或功能区相同 假基因(pseudogene,Ψ) 与有功能的基因相似,不表达基因产物的基因。 2.3 真核生物基因组 ? G? A? ? ? ??2 ??1 Alu 10 kb 珠蛋白基因簇中的假基因 线粒体基因组 2.3 真核生物基因组 线粒体基因组 人线粒体基因组的特点: 人线粒体基因组为16,569bp的双链闭环分子,一条链为重链(H链),一条链为轻链(L链),两条链均有编码功能,每个mtDNA分于编码13种蛋白质和24种结构RNA (22rRNA,2tRNA). 线粒体DNA为母系遗传. 2.3 真核生物基因组 重点 基因的概念及结构 原核生物基因组结构特点 真核生物基因组结构特点 The End! 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 类核(nucleoid):细菌染色体在 细胞内形成的一个致密区域 Nucleoid 质粒plasmid 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 大肠杆菌染色体结构 蛋白质核心 超螺旋DNA环 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 由一条环状双链DNA分子组成,通常只有一个DNA复制起点。 大肠杆菌染色体DNA 复制起始区(OriC) 复制终止区(TerC) 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 结构基因大多组成操纵子(operon) 乳糖操纵子 lac operon t a y z o p structural gene promoter terminator operator ?-半乳糖苷酶z ?-半乳糖苷透酶y ?-半乳糖苷乙酰转移酶a 多个功能相关的结构基因成簇串联排列,与上游共同的调控区和下游转录终止信号组成的基因表达单位。 结构基因大多组成操纵子(operon) 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 C 值:4,639,221 bp 基因数:4288 基因大小:950bp/gene 基因间隔:118bp/2gene 1.基因密度非常高,编码区在 基因组中所占比例大; 2.结构基因没有内含子,多为 单拷贝,rRNA基因为多拷贝; 3.重复序列很少,重复片段为 转座子; 50kb 4.不同的原核生物基因组的GC含量 (GC content)变化很大(25%-75%) Escherichia coli Micrococcus luteus 藤黄微球菌 Bacillus subtilis 枯草杆菌 粘质沙雷菌 大肠杆菌 Shigella flexnerl 志贺氏杆菌(痢疾) Salmonella typhimurium 鼠伤寒沙门菌 Klebsiella pneumoniae 肺炎克雷伯士氏杆菌 Mycopiasma capricolum Serratia marcescens %GC 51 51 52 55 58 52 37 66 61 43 45 33 39 25 75 73 69 支原体 2.2.1 原核生物基因组结构和功能特点 5.有编码同工酶的等基因(isogene) 群体内不同个体基因组中其他遗传背景完全一致条件下仅有的差异基因。 分支酸别构酶 entC isochorismate synthase entB isochorismatase 6. 非编码区主要是调控序列 2.2.2 转座因子 转座,或称移位(transposition): 转座因子在基因组 不同位置间的移动。 Barbara McClintock 麦克林托克 1902-1992 转座
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