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基因工程实验指导
邢万金 扈廷茂 编写
2005年6月(第二次修订)
内蒙古大学生命科学学院生物系基因工程实验室
目 录
基因工程实验注意事项———————————————————————————(2)
实验流程参考图——————————————————————————————(3)
第一部分 质粒DNA的提取和酶切电泳鉴定
实验一 质粒DNA的小量制备———————————————————————(4)
实验二 质粒DNA电泳鉴定————————————————————————(6)
实验三 质粒DNA的酶切—————————————————————————(8)
第二部分 目的基因的获得和重组载体的构建
实验四 PCR扩增制备目的基因———————————————————————(10)
实验五 目的基因片段与载体连接——————————————————————(12)
实验六 从琼脂糖凝胶中回收DNA片断———————————————————(14)
第三部分 感受肽细胞的制备和转化及筛选鉴定
实验七 感受态菌的制备——————————————————————————(16)
实验八 细菌转化—————————————————————————————(18)
实验九 转化克隆的筛选和鉴定———————————————————————(20)
第四部分 目的基因在原核细胞中表达与SDS鉴定
实验十 外源基因的诱导表达————————————————————————(22)
实验十一 SDS检测表达蛋白—————————————————————(24)
附 录
附录1:表达载体pET-His的相关资料————————————————————(27)
附录2:从NIH查阅的nattokinase(纳豆激酶)序列之一————————————(28)
附录3:本实验所用的克隆载体图——————————————————————(29)
基因工程实验注意事项
上实验课的学生每两人分为一个小组。
课前要提前预习实验内容,弄懂实验设计的原理,理清实验顺序。认真填写《本科基因工程实验论文开题报告》,制定实验方案(没有方案或方案不合理者不能进入实验操作)。
实验指导中所写的实验一、实验二等并非严格的实验顺序,只是提供一种相关的实验操作技术。各小组学生应根据整体的实验策略制定自己的实验顺序和计划。
由于实验内容多,时间短,多数实验需要同时或穿插进行,一定要做好统筹安排。
本实验课中的所有单项实验都属于一个整体流程。实验时间安排上没有上下午晚上等严格的作息安排,一切服从实验进度,必须在10天之内完成。
实验的每一步都要详细地记录操作内容、时间、步骤、结果等,以备查询!
对任何自己不熟悉的实验仪器都不要随意操作(尤其是微量移液器!)。在操作的过程中发现任何意外的现象都要及时向任课教师汇报。
写作实验报告和实验论文一定要文理通顺、逻辑清晰、图表说明详细,讨论分析透彻(包括操作的错误)。
在实验室内不能大声喧哗。
10.在实验的过程中制造的任何垃圾都要丢到垃圾筐里(或先放在自己的桌面一角),严禁随地投弃!特别注意对废弃细菌的杀灭和有毒垃圾的定点投放。
11.实验结束后要把用过的器皿清洗后归放整齐并清点数目,向教师汇报征得同意后方可离开实验实。
值日组的同学最后离开,等待清扫实验室的卫生,关闭门窗水电。
13.实验时损坏的任何物品都要及时申报。
实验流程参考图
第一部分 质粒DNA的提取和酶切电泳鉴定
实验一 质粒DNA的小量制备
1.目的
学会最常用的小量制备质粒DNA的碱裂解方法。
2.原理
根据共价闭合环状质粒DNA与线性DNA在拓扑学上的差异来分离。在pH12.0(12.5这个狭窄的范围内,线性DNA双螺旋结构解开而被变性。尽管在这项的条件下共价闭合环状质粒DNA也会变性,但两条互补链彼此互相盘绕,仍会紧密结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液使pH恢复中性时,共价闭合环状质粒DNA复性快,而线性的染色体DNA复性缓慢,经过离心与蛋白质和大分子RNA一起沉淀下去。
3.器材
超净工作台,接种环,酒精灯,台式离心机,旋涡混合器,微量移液取样器,1.5ml微量离心管,恒温摇床,摇菌试管,双面微量离心管架,试管架,标签纸,磁力搅拌机。
4.试剂
pET-his质粒载体菌,pMD18-T-NK载体菌,LB培养基1000ml(含100ug/ml氨苄青霉素),葡萄糖/Tris/EDTA(GTE)溶液(溶液 I),NaOH/SDS溶液(溶液 II),KAc溶液(pH4.8)(溶液 III),RNase A,95%乙醇,70%乙醇,TE buffer(pH8.0)。
5.实验准备
氨苄青霉素储存液
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