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基因组计划研究概况 彭梁+1201051039 基因组计划的研究概况 ☆（一）人类基因组计划 （二）水稻基因组计划 （三）宏元基因组计划 （一）人类基因组计划 ⅰ人类基因组计划产生的背景 ⅱ人类基因组计划产生的任务 iii人类基因组计划实施的策略 ④人类基因计划的研究进展 ⑤人类功能基因组的研究 人类基因组计划产生的背景 人类基因组计划（HGP），曼哈顿原子弹研制，阿波罗登月计划被誉为20世纪人类科技发展史上的伟大创举。 美国国会决定由美国国家研究委员会（NIH）和能源部（DOE）从1990年10月1日起组织实施人类基因组计划，美国，日本，法国，德国和中国相继加入到伟大的计划中。 人类基因组计划产生的任务 人类基因组计划的最终任务就是要破译人体遗传物质DNA分子所携带的全部遗传信息，完成后将获得物理图谱，遗传图谱，序列图谱和转录图谱。 研究内容还包括创建计算机分析管理系统，检验相关伦理，法律及社会问题，进而通过转录物组学和蛋白质组学等相关技术对基因表达图谱，基因突变进行分析，获得与疾病相关基因的信息。 人类基因组计划实施的策略 ⅰ染色体作图 将基因组进行分解，分解为容易操作的小的结构域。 ⅱ染色体作图的分类 遗传连锁图 物理作图 遗传连锁作图 ⅰ基本单位:厘摩（cM） 一厘摩表示两个连锁的遗传标记在每次减数分裂中发生的重组概率为1％ ⅱ采用多态性标记 ⅰ一类人的DNA可以在 该位点出现某种限制 制性核酸内切酶水解 ②一人类则不能。 物理作图 ⅰ基本单位：千碱基对（kb）或百万碱基对（mb） ⅱ基本布骤 （1）大量定位明确，分布均匀的序列标记，可用PCR的方法扩增。序列标签位点（STS） （2）在大量STS的基础上构建覆盖每条染色体的大片段DNA的连续克隆系（YAC），最终完成全系列的测定奠定基础。 BAC DNA测序的基本步骤 Ⅰ将待测的BAC DNA随机打断，选取较小的片段（1.6-2kb） Ⅱ将这些片段克隆到测序载体中，构建出随机文库 Ⅲ挑选随机克隆进行测序，达到对BAC DNA 8-10倍的覆盖率。 Ⅳ将测序所得的相互重叠的随机序列组装成连续的重叠群 Ⅴ利用步移或引物延伸的方法填补存在的间隙 Ⅵ获得最高质量的，连续的，真实的完成序列。 完成序列 完成序列的条件 ⅰ序列的差错率低于1/10000 ⅱ序列必须是连贯的，不存在缺口（gap） ③测序采用的克隆必须能够真实代表基因组结构。 覆盖所有缝隙被填补该区域的BAC连续克隆系之间的缝隙被完全填补。 BAC克隆而言，其内部的所有缝隙被填补后的序列 工作草图 工作草图是在1998年提出的，它是指通过对染色体上定位明确的BAC连续克隆系进行4-5倍的覆盖率的测序（单个BAC克隆水平，覆盖率不小于3倍），从而获得90％以上的基因组序列，其差错率小于1％ 工作草图的提出加大测序的覆盖率，并填补其中的缝隙，可逐步获得完成序列。 全基因组测序的方法 全基因组鸟枪法 （散弹法） cDNA测序法（EST测序） 测序的其他方法 （1）荧光染料和激光共聚焦技术的应用，使得DNA序列测定得到不断的发展。高质量的聚合酶和高度敏感的荧光染料的出现，还有薄板凝胶系统测序仪的出现，使得测序实现高通量产出。 （2）毛细管电泳仪的问世，极大的提高了测序的产出量。 人类基因组计划的研究进展 人类基因组计划工作主要包括： （1）人类基因遗传图谱 （2）基因组DNA物理图谱 （3）基因组DNA序列图谱 （4）全基因组基因图谱（鉴别人类基因组中全部基因，尤其是疾病基因的定位）。 基因图谱的基本意义：鉴别人类目前认为的全部基因，其中包括决定各种RNA基因。 人类功能基因组研究 后基因计划 研究基因的功能，以及它们发挥的功能机制。 目的：阐明基因组所表达的真正执行生命活动的全部蛋白质的表达规律和生物功能。 通过对人类基因组图谱的解读，借助