8. Northern blot Northern blot 原理: 通过电泳的方法将不同的RNA分子依据其分子量大小加以区分,然后通过与特定基因互补配对的探针杂交来检测目的片段。 分子探针的类型 cDNA probe:杂交反应有较高的专一性。因其为双链结构,需加热变性解链。解链后只有半数DNA链与特定的mRNA杂交,另一半DNA链则与mRNA竞争,并导致DNA链的自我“退火”(既重新形成双链)。 mRNA probe(互补的RNA):为单链结构,杂交反应专一性高,杂交链稳定,制备复杂。 Oligonucleotide probe:由DNA合成仪合成,制备简单,由于链不长,又是单链,较易穿过组织,操作方便,但杂交链因其链短而不够稳定。 首先需要从组织或细胞中提取总RNA ,或者再经过寡聚(dT)纯化柱进行分离纯化得到mRNA。然后RNA样本经过电泳依据分子量的大小对被分离,随后凝胶上的RNA分子被转移到膜上。膜一般都带有正电荷,核酸分子由于带负电荷可以与膜很好的结合。转膜的缓冲液含有甲酰胺,它可以降低RNA样本与探针的退火温度,因而可以减少高温环境对RNA降解。RNA分子被转移到膜上后须经过烘烤或者紫外交联的方法加以固定。被标记的探针与RNA探针杂交,经过信号显示后表明需检测的基因的表达。Northern blot实验中阴性对照可以采用已经过RT-PCR或基因芯片检测过
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