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DDBJ简介 日本DNA数据库DDBJ(DNA Data Bank of Japan)，于1984年建立，1987年正式服务。由日本国家遗传学研究所（NIG National Institute of Genetics)维护更新。 DDBJ为一级核酸数据库，是世界三大DNA数据库之一，与NCBI的GenBank，EBI的EMBL数据库共同组成国际DNA数据库，每日都交换更新的数据和信息，每年四版，并主持两个国际年会:国际DNA数据库咨询会议和国际DNA数据库协作会议，互相交换信息，因此三个库的数据是相通的。 Sequence submission (序列提交） Nucleotide sequence submission system （以前)称SAKURA):核酸序列提交系统 Mass submission(MSS):大量提交途径 Nucleotide sequence submission system 数据提交可用日文或英文两种文字，用户可按软件提供的模板格式（start from template ）提交数据，也可从Start进行标准格式提交，该途径首先要求用户提供联系人的Email地址，输入电子邮件地址后数据库马上给用户提供一个记录号，用于标记将要提交的数据信息，接着用户需提供联系人的姓名及确 切地址，这些信息填好后即生成一个 有关前述信息的记录，用户可以马上上传数据内容也可以日后追加（提交页面的Resume)，数据内容包括参考信息、序列信息及生物体信息等。 Nucleotide sequence submission system 参考信息要求提供者提供来信信息的出版状况包括准备中（InPreparation）、submitted for publication （投寄中）、再版（In press） 、已出版（Published）只在本数据库出版（Published only in Datebase）等选项，刊名、年、卷、页码及作者姓名等内容。序列信息要求提供序列的长度、序列内容等，其中数据可直接复制或粘贴到该页面进行提交，但在数据量很大无法粘贴时也可通过Upload将装载有关数据的文件直接上传。生物体信息要求提供分子类型，生物体名称、细胞系、细胞类型、染色体等37项内容，该途径数据提交格式较规范，为DDBJ推荐使用的途径。 Mass submission(MSS)于下列三种情况下推荐使用 同时提交大量数据 提交序列较长，内容复杂如有大量特征信息的基因组数据的情况 不适于SAKURA提交，即Nucleotide sequence submission system 该途径要求在数据正式提交之前，通过mass@ddbj.nig.ac.jp与该机构工作人员取得联系，并附有信息提供数据提交日期， 要求获得登录号的日期、公布日期及联系人信息（姓名、联系地址、Email等）。 Sequin途径 为一种独立的数据处理软件，由NCBI开发，用于Genbank、EMBL、DDBJ序列数据的提交与更新。它能在Macintosh PC/Windows及UNIX系统的计算机上运行操作，有单机版和网络版之分，后者可多人合作使用。该软件可通过DDBJ的匿名FTP服务器下载（ftp://ddbj.nig.ac.jp/pub/Sequin） Getentry （登录号检索） 通过登录号来检索DDBJ核酸序列数据库，最多可同时输入10个号码进行检索，各号码之间用空格或,加以分隔，连续号码可用“-”表示多个连续的号码。例：D11111 D11112或D11111,D11112或D11111-D11114或D11111-4 Getentry在对DDBJ数据库进行检索时，输入的号码除了登录号以外还可以用Locus name、Gene name 、Product name、Clone name和Patent号等。 Getentry （登录号检索） 通过专利号检索时，必须删去中间的空格，可省略其中的非字母数字式符号，如“_”、“-”、“：”和“/”. 检索结果可直接在页面得到显示，也可通过E-mail的形式获得，检索结果与其它数据库的兼容性好，可与Normal、FASTA、EMBL、Transl、CDS、Qvalue、XML等数据库兼容。 ARSA(全面序列注释检索） 它有快速检索（Quick Search）和高级解锁（Advanced Search）两种检索途径。 快速检索（Quick Search）可以同时选择多个数据库进行检索；快速检索可用逻辑符“OR”“AND”来描述多个检索词之间的逻辑关系。 快速检索只对来自“ID”、“Molecule”、“Description”、“Authors”