生物信息数据处理_实验报告_2012212333_张宝宝讲义.docVIP

生物信息数据处理实验报告 学院： 生物信息学院 专业：生物信息学 班级：0601203 学号：2012212333 姓名：张宝宝 2014年6月目录实验1：Linux常用命令练习（1） 实验2：Linux常用命令练习（2） 实验3：vi编辑器练习 实验4：Shell程序设计基础（1） 实验5：Shell程序设计基础（2） 实验6：Shell程序设计基础（3） 实验7：Shell程序开发（1）：gff文件处理程序 实验1：Linux常用命令练习（1） 一、实验目的 1．掌握Linux登录、退出方法； 2．掌握常用Linux文件操作和目录操作命令。 二、实验环境 操作系统、软件及版本等 二、实验内容及实验记录 三、实验中遇到的问题及解决办法 实验中会遇到文字乱码的问题，把默认的改为 UTF-8. 实验2：Linux常用命令练习（2） 一、实验目的 1. 掌握帮助、进程管理、压缩解压缩、网络连接与文件传输及其它命令； 二、实验环境 1. 操作系统：客户端Windows，服务器端Linux 2. 主要软件：putty 二、实验内容及实验记录 三、实验中遇到的问题及解决办法 实验3：vi编辑器练习 一、实验目的 1. 了解vi编辑器的两种操作模式：命令模式和插入模式； 2. 掌握vi编辑器的操作方法。 二、实验环境 1. 操作系统：客户端Windows，服务器端Linux 2. 主要软件：putty 三、实验内容及实验记录 四、实验中遇到的问题及解决办法 实验4：Shell程序设计基础（1） 一、实验目的 1. 掌握Linux环境变量的设置方法； 2. 了解Shell特殊字符的含义； 3. 掌握Shell变量的概念及其使用方法。 二、实验环境 1. 操作系统：客户端Windows，服务器端Linux 2. 主要软件：putty 三、实验内容及实验记录 $PATH：决定了shell将到哪些目录中寻找命令或程序 　　$HOME：当前用户主目录 　　$MAIL：是指当前用户的邮件存放目录。 　　$SHELL：是指当前用户用的是哪种Shell。 　　$HISTSIZE：是指保存历史命令记录的条数 　　$LOGNAME：是指当前用户的登录名。 　　$HOSTNAME：是指主机的名称，许多应用程序如果要用到主机名的话，通常是从这个环境变量中来取得的。 　　$LANG/LANGUGE：是和语言相关的环境变量，使用多种语言的用户可以修改此环境变量。 　　$PS1：是基本提示符，对于root用户是#，对于普通用户是$，也可以使用一些更复杂的值。 　　$PS2：是附属提示符，默认是“”。可以通过修改此环境变量来修改当前的命令符，比如下列命令会将提示符修改成字符串“Hello,My NewPrompt :) ”。 　　　　# PS1= Hello,My NewPrompt :) 　　$IFS：输入域分隔符。当shell读取输入时，用来分隔单词的一组字符，它们通常是空格、制表符和换行符。 　　$0：shell脚本的名字。 　　　　例如，在我的Linux系统中： 　　　　$ echo $0 　　　　/bin/bash 　　$#：传递给脚本的参数个数。 　　$$：shell脚本的进程号，脚本程序通常会用它生成一个唯一的临时文件，如/tmp/tmfile_$$ 　　　　例如，在我的Linux系统中： 　　　　$ echo $$ 　　　　31038 #表示当前shell进程号为31038　实验5：Shell程序设计基础（2） 一、实验目的 1. 了解程序设计控制结构的概念； 2. 掌握Shell编程常用的控制结构。 二、实验环境 1. 操作系统：客户端Windows，服务器端Linux 2. 主要软件：putty 三、实验内容及实验记录 四、实验中遇到的问题及解决办法 权限的问题，改变权限，chmod 777 即可 实验6：Shell程序设计基础（3） 一、实验目的 1. 掌握Shell程序的调试方法和技巧。 二、实验环境 1. 操作系统：客户端Windows，服务器端Linux 2. 主要软件：putty 三、实验内容及实验记录 四、实验中遇到的问题及解决办法 生物信息学大实验 8