蛋白质的高级结构分析报告.ppt

科学网论坛：/ 丁香园论坛： / 小木虫论坛 /bbs/ 主要内容 第1节 空间构象的研究方法 第2节 维持蛋白质三维结构的作用力 第3节 多肽链折叠的空间限制：肽单位和肽 平面，α-碳原子的二面角 第4节* 蛋白质的二级结构：α-螺旋，β-折叠，β-转角与无规卷曲 第5节* 纤维状蛋白质：α-角蛋白和β-角蛋白，胶原蛋白与三股螺旋结构 第6节* 超二级结构与结构域 第7节* 球状蛋白质与三级结构 第8节 膜蛋白的结构 第9节 蛋白质折叠与结构预测 第10节寡聚蛋白质的构象与四级结构 X射线衍射法 X射线衍射法 紫外差光谱 各种因素对吸收谱带的影响表现为谱带位移、谱带强度的变化、谱带精细结构的出现或消失等。谱带位移包括蓝移和红移。蓝移指吸收峰向短波长移动，红移指吸收峰向长波长移动。极性增大会引起蓝移，反之引起红移。 荧光与荧光偏振 荧光（fluorescence）是分子吸收了较短波长的光（通常是紫外光和可见光），在很短的时间内发射出比照射光波长较长的光。根据物质的荧光波长可确定其分子结构；根据荧光强度可测定物质的含量。 荧光分析影响因素 1）溶液pH值 2）温度 3）溶剂极性的影响 4）激发光源 5）器皿污染的影响 6）内滤效应的影响 7）稀样品溶液的影响 荧光偏振与荧光探针结合常常用于测定蛋白质的疏水微区，研究酶与底物、辅因子与抑制剂结合过程中蛋白质构象的变化。 荧光探针：与蛋白质或其他大分子结构非共价相互作用而使一种或几种荧光性质发生改变的小分子物质。 圆二色性 圆二色性：由于包含发色团的分子的不对称性，而引起左右两圆偏振光具有不同的光吸收的现象。主要用于测定蛋白质的立体结构， 圆二色性对R和L两种圆偏振光吸收程度不同的现象。这种吸收程度的不同与波长的关系称圆二色谱，是一种测定分子不对称结构的光谱法。 核磁共振（Nuclear Magnetic Resonance即NMR）是处于静磁场中的原子核在另一交变电磁场作用下发生的物理现象。通常人们所说的核磁共振指的是利用核磁共振现象获取分子结构、人体内部结构信息的技术。 并不是所有原子核都能产生这种现象，原子核能产生核磁共振现象是因为具有核自旋。原子核自旋产生磁矩，当核磁矩处于静止外磁场中时产生进动核和能级分裂。在交变磁场作用下，自旋核会吸收特定频率的电磁波，从较低的能级跃迁到较高能级。这种过程就是核磁共振。 广义的 范德华力 疏水作用是指水介质中球状蛋白质的折叠总是倾向于把疏水残基埋藏在分子内部的现象。 疏水作用及疏水和亲水的平衡在蛋白质结构与功能的方方面面都起着重要的作用。 蛋白质溶液系统的熵增加是疏水作用的主要动力。当疏水化合物或基团进入水中时，它周围的水分子将排列成刚性的有序结构即所谓笼形结构笼形结构(clathrate structure)。与此相反的过程（疏水作用），排列有序的水分子（笼形结构）将被破坏，这部分水分子被排入自由水中，这样水的混乱度增加即熵增加，因此疏水作用是熵驱动的自发过程。 （3）肽键C-N键长为0.132nm,比一般的C-N单键 (0.147nm)短，比C=N双键(0.128nm)要长， 具有部分双键的性质(partial double-bond character)，不能旋转。而?Cα-COOH、C-NH2，为真正单键(pure single bond)，可以旋转。 无规则卷曲 纤维状蛋白质的氨基酸序列很有规律，它们形成比较单一的、有规律的二级结构，结果整个分子形成有规律的线形结构，呈现纤维状或细棒状，分子轴比（轴比：长轴/短轴）大于10，轴比小于10是的球状蛋白质。广泛分布于脊椎和无脊椎动物体内，占脊椎动物体内蛋白质总量的50%以上，起支架和保护作用。 1 不溶性：角蛋白、胶原蛋白和弹性蛋白 2 可溶性：肌球蛋白和血纤维蛋白原 肌球蛋白：在横纹肌中是构成粗肌丝的主要成分。由6条肽链组成的纤维状蛋白质，包括两条相同的重链和两对轻链组成。重链的大部分是α螺旋，其头部具有ATP酶活性，并与肌动蛋白结合，而轻链具有激酶活性。 原肌球蛋白(tropomyosin, Tm)是细肌丝中与肌动蛋白的结合蛋白，分子量为2×35kDa, 长为41nm, 由两条平行的多肽链组成α螺旋构型，每条原肌球蛋白首尾相接形成一条连续的链同肌动蛋白细肌丝结合 。 膜蛋白的结构 膜周边蛋白：水溶性球蛋白 静电作用与膜相连 膜内在蛋白：与脂双分子层强缔合的膜蛋白 脂锚定膜蛋白：与膜