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云南薏苡种质资源农艺性状的主成分和聚类分析.pdf
植物遗传资源学报2015,16(2):277⁃281
Journal of Plant Genetic Resources DOI:10.13430/ j.cnki.jpgr.2015.02.010
云南薏苡种质资源农艺性状的主成分和聚类分析
李春花,王艳青,卢文洁,王莉花
(云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/ 云南省农业生物技术重点实验室/
农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,昆明650223)
摘要:为了揭示云南薏苡种质资源多样性,发掘薏苡资源中的有益基因,利用主成分分析和聚类分析,对收集的65 个薏苡
种质资源的13 个农艺性状进行多样性评价。 结果表明,云南薏苡资源存在丰富的遗传多样性,其中栽培种的分枝数和分蘖数
的遗传变异系数分别达到574%和475%,野生种百粒重的遗传变异系数达到604%。 应用主成分分析将云南薏苡13 个性
状简化为7 个主成分,其累积贡献率为8567%,以叶片宽因子贡献率最高,为49%。 采用系统聚类分析,将65份供试材料在
遗传距离1621水平上聚为5 个大类,可区分为株高较矮叶片较短型、株高较高叶片较长型以及3 个特殊型。
关键词:云南薏苡;主成分分析;聚类分析;遗传多样性
The Principal Component and Cluster Analysis of Agronomic Traits of
Coix Germplasm Resources in Yunnan
LI Chun⁃hua,WANG Yan⁃qing,LU Wen⁃jie,WANG Li⁃hua
(Biotechnology and GermplasmResources Institute,YunnanAcademy of Agricultural Sciences/
YunnanProvincialKey Lab of Agricultural Biotechnology/
Key Lab of Southwestern Crop Gene Resources and GermplasmInnovation,Ministry of Agriculture,Kunming 650223)
Abstract:The 13 agronomiccharactersofthecollected65coixgermplasmresourcesinYunnanwereinvestigated
through principal component and cluster analysis in order to identify the diversity of coix germaplasm and find the
benefit genes Theresultsshowedthat the abundant genetic diversity existed amongthe coix inYunnan,andthe co⁃
efficient ofvariationforbranchingandtillerdevelopmentof cultivatedspecieswereupto574% and475%,respec⁃
tively,andthecoefficientofvariationfor 100⁃grainweightofwildspecieswasupto604%. Thefindingsofprincipal
components analysis showed that the thirteen traits were simplified into seven principal components (over 8567%
contribution)and the contribution of theleaf bladewidth (49%)wasthehighest. Theresultsof thecluster analysis
indicated that all of the accession
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