牦牛HORMAD1基因的克隆及其生物信息学分析.pdfVIP

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2016-05-13 发布于安徽
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牦牛HORMAD1基因的克隆及其生物信息学分析.pdf

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生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 2012年第11期牦牛 HORMAD1 基因的克隆及生物信息学分析 1，2，3 1 2，3 2，3 2，3 2，3 2，3 金帅齐社宁阎萍梁春年郭宪包鹏甲裴杰 2，3 2，3 2，3 2，3 2，3 褚敏丁学智刘文博吴晓云刘建 1 2 （兰州大学基础医学院，兰州 730030 ；中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所，兰州 730050 ； 3 甘肃省牦牛繁育工程重点实验室，兰州 730050）摘要：利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1 基因编码区序列，并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明，牦牛HORMAD1 基因包含一个长度为1 182 bp 的开放阅读框，编码393 个氨基酸；其编码蛋白属于亲水性蛋白，无明显的信号肽，含有很多个磷酸化位点。二级结构主要以无规则卷曲和α 螺旋为主。HORMAD1 基因编码产物氨基酸邻接系统树表明，牦牛HORMAD1 与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1 氨基酸遗传距离较近，具有高度相似性。关键词：牦牛 HORMAD1 基因克隆生物信息学分析 Cloning and Bioinformatics Analysis of HORMAD1 Gene in Yak 1，2，3 1 2，3 2，3 2，3 2，3 2，3 Jin Shuai Qi Shening Yan Ping Liang Chunnian Guo Xian Bao Pengjia Pei Jie Chu Min2，3 Ding Xuezhi2，3 Liu Wenbo2，3 Wu Xiaoyun2，3 Liu Jian2，3 1 2 （， 730030 ；， School of Basic Medicine Lanzhou University Lanzhou Lanzhou Institute of Husbandry and Pharmaceutical Sciences of CAAS 3 ， 730050 ） 730050