不同色彩矮牵牛DFR基因的克隆及生物信息学分析.pdfVIP

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期 2013 9 不同色彩矮牵牛 DFR 基因的克隆与生物信息学分析 1 1 1 2 3 2 2    朱奇朗  李晓波  肖向文  李雪源  黄先忠  郑巨云  艾先涛 （1. 中国科学院新疆理化技术研究所 干旱区植物资源化学重点实验室，乌鲁木齐 830011 ；2. 新疆农业科学院经济作物研究所， 乌鲁木齐 830091 ；3. 石河子大学生命科学学院 农业生物技术重点实验室，石河子 832003） 摘 要 ： 二氢黄酮醇4-还原酶基因（ ）是花色素合成途径中的一个关键基因。以新疆种植的白、红和蓝色矮牵牛为试 DFR 验材料，通过同源克隆的方法从花中克隆到3 个完整的DFR 基因的全长编码序列 （CDS ），与已知的矮牵牛DFR 基因（GenBank 登录号 ：X 15537 ）序列的相似性分别为97.79 %、96.59% 和 97.99% ，分别命名为 ， 和 ；3 个基因编码 PhDFR1 PhDFR2 PhDFR3 380 个氨基酸，同已知矮牵牛DFR 基因编码的蛋白（GenBank 登录号 ：CAA33544 ）的同源性分别是95.53%、94.2 1% 和95.79% ； 生物信息学分析表明，3 个蛋白均具有NADB- Rossmann 家族中高度保守的NADPH 结合位点、底物特异性结合位点。3 个矮牵牛 品种DFR 都不具有信号肽，为亲水蛋白，定位于细胞质的可能性最高；均具有两个跨膜结构，α-螺旋和β-折叠是3 个DFR 的主要 二级结构元件，并且形成了β-α-β-α-β的Rossmann 折叠，整本上呈对称分布。利用同源建模分析3 个DFR 蛋白与已知葡萄的DFR 晶体结构有很高的相似性。系统进化树分析表明，PhDFR1、PhDFR2 、PhDFR3 与已知矮牵牛DFR 蛋白亲缘关系最近。 关键词 ： 矮牵牛 二氢黄酮醇4-还原酶 同源克隆 生物信息学分析 - Cloning and Bioinformatical Analysis of Dihydroflavonol 4 reductase （ ） Gene DFR from Petunia hybrida with Different Color 1 1 1 2 3 2 2 Zhu Qilang Li Xiaobo Xiao Xiangwen