基本过程: 1. 从一对处于不同发育阶段(或不同基因型) 的细胞群体中分离总mRNA,并用3’-端锚定引物作反转录合成第一链cDNA; 2.用5’-端随机引物和3’-端锚定引物组成的引物对,在加入放射性同位素标记的dNTP的条件下,以第一步反转录产物作模板进行PCR扩增。 3.将扩增样品在变性的DNA测序胶中进行电泳分离; 4.将有关的差别表达的DNA条带从测序胶上切割下来回收其DNA片断; 5.胶块中的DNA量非常少,不能用于克隆,需进行二次扩增; 6.将克隆的特定的DNA分别同基因组DNA及总mRNA作Southern或Northern杂交,测序; 7.以此目的片断作探针从cDNA文库中或基因组文库中筛选全长的cDNA克隆或基因组克隆。 优点: 1.可以同时比较多个样品表达的差异; 2.可以同时检测“上游”及“下游”的基因; 3.检测灵敏度高,所需样品少,经PCR扩增一些低峰度的mRNA也可以被检测出来; 4.结合使用了PCR和序列胶电泳分析两项技术,使本方法显得较单方便。 局限性: 1.假阳性比例高(50%~75%); 同一长度的条带,含有多种DNA序列;邻近条带回收时,造成人为误差; mRNA3’-端序列保守性高,而常用3’-端cDNA作探针。 2.扩增的差别条带分子长度比较短小(110~450bp); 应用表达
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