第一章
代谢工程定义、主要研究内容及应用方向
定义:通过某些特定生化反应的修饰来定向改善细胞的特性,或运用重组DNA技术来创造新的化合物。
主要内容:①生物合成相关代谢调控和代谢网络理论;
②代谢流的定量分析;
③代谢网络的重新设计;
④中心代谢作用机理及相关代谢分析;
⑤基因操作。
应用方向:
1. 提高细胞现存代谢途径中天然产物的产量;
2. 改造细胞现存的代谢途径,使其合成新产物,这种新产物可以是中间代谢产物或修
饰型的最终产物;
3. 对不同细胞的代谢途径进行拟合,构建全新的代谢通路,从而产生细胞自身不能合
成的新产物;
4. 优化细胞的生物学特性,如:生长速率、极端环境条件和耐受性等。
系统研究代谢流及其控制机制包括的三大基本步骤
①建立一种能尽可能多的观察代谢网络并测定其流量的方法。
为了做到这一点,通常从测定细胞外代谢产物的浓度入手进行简单的物料平衡。
②在代谢网络中施加一个已知的扰动,以确定在系统松散之后达到新的稳态时的代谢流。
常用的扰动方式包括启动子的诱导、底物流加、特定碳源消除或物理因素变化等。
③要系统分析代谢流扰动的结果。
节点、柔性节点、强刚性节点、弱刚性节点、依赖型代谢网络、
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