lncRNA研究策略与技术研究背景:长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是一类不编码蛋白的RNA分子,长度在200bp以上,起初被认为是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能;近期的研究表明lncRNA具有保守的二级结构,可以与蛋白、DNA和RNA相互作用,参与多种生物学过程的调控,尤其在肿瘤当中发挥了重要的调控角色,如染色质修饰、转录激活和抑制、转录后调解以及作为miRNA的诱导分子干扰基因的表达等,图1所示。随着高通量测序技术的发展,越来越多的lncRNA被注释,但是绝大多数的lncRNA的功能仍然不清楚,因此lncRNA的研究是一片非常广阔的未知领域,具有极大的研究价值和意义。图1.lncRNA参与肿瘤生物学调控,红色线状图表示lncRNA。A.染色质重组B.转录激活和抑制C.蛋白抑制D.转录后修饰E.诱导分子锐博生物提供研究思路:差异lncRNA筛选的研究方法:案例解读:案例(一)RNAseq发现lincRNA1.2011年,Rinn研究小组对24种组织样本进行RNA测序发现了8000多个人的lincRNA图2.A.利用RNA-seq预测lincRNA的流程图B.多个参考数据库找到的lincRNA的数量及交集及用软件组装的结果2.lincRNA的表达具有组织特异性图3.lincRNA和mRNA在不同组织当中的表达情况案例(二)l
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