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一、基因组概述 即:human genome project,HGP (一)结构基因组学 人类基因组计划: 一个细胞所包含DNA结构的一整套基因, 即记录基因组全部DNA序列。 人类基因组计划研究的内容: 1、遗传图谱 2、物理图谱 3、序列图谱 4、转录图谱 核心内容是绘制四张图谱: 又称基因连锁图或染色体图。是以具有多态性的遗传标记为界标,以遗传学距离为图距的基因组图。 通过计算在细胞减数分裂过程中,由于同源染色体间交换所导致的遗传标记间发生重组的频率,来确定这两个标记在染色体上相对位置的图谱。 1.遗传图 是以一段已知的特异DNA序列为界标,以Mb或kb为图距所展示的基因组图。它能反映生物基因组中基因或标记间的实际距离。 这段已知的特异DNA序列称为序列标记位点,Sequence tagged site,STS。 2.物理图 3.序列图 4.转录图 最高层次和最详尽的物理图,获得人类全基因组的序列图谱。 cDNA图谱或表达序列标记图谱,是一种以表达序列标签为“位标”绘制的分子遗传图。 (二)功能基因组学 后功能基因组学,基因组动态的生物学功能的研究。 蛋白质组、转录组、代谢组、癌基因组、疾病基因组、药物基因组、环境基因组、行为基因组等。 (三)比较基因组学 在基因组层次上,比较不同基因组之间的异同。 对于人类的健康、疾病的诊断、预防和个体化治疗都是很重要的。 不同的人种、族群、群体、以及不同的个体等。 (四)药物基因组学 药物基因组学是主要以阐明药物代谢、药物转运和药物靶分子的基因多态性与药物作用包括疗效和毒副作用之间关系的一门科学,是一门新兴的研究领域。 1.药物基因组学研究的分子基础: ⑴药物代谢酶的多态性; ⑵药物转运蛋白的多态性; ⑶药物作用靶点的多态性。 是基因的多态性,包括: 药物基因组学是以提高药物的疗效及安全性为目标,研究影响药物吸收、转运、代谢、消除等个体差异的基因特性,并根据不同病人的基因差异选择更加科学优化的治疗方案与剂量,以此为平台开发新药,最终达到药物治疗的个性化、安全化、经济化。 2.药物基因组学研究的目标: 3.药物基因组学研究的主要策略: 选择药物起效、活化、排泄等过程相关的候选基因进行研究,鉴定基因序列的变异,研究基因多态性与药效多样性的关系。 药物基因组学的研究不需要发现新的基因。 开辟全新的药物开发领域 合理用药与个体化治疗 基因检测 用于药物的临床和临床前研究 4.药物基因组学的应用: (五)疾病基因组学 是从基因组中分离重要疾病的疾病基因与相关基因,确定起致病机制。 HGP的诞生: 1985年5月,美国加州举行第一次会议 美国能源部提出测定人类基因组序列的动议。 1988年美国成立“国家人类基因组研究中心”, DNA双螺旋提出者Watson出任第一任主任。 1990年10月1日正式启动美国国会批准的HGP— 在15年内,投入30亿美元,对人类基因组分析。 2000年6月26日,提前一年完成基因组基本构图。 2003年4月完成全部计划,比原计划提前两年。 中国完成了HGP“工作框架图”中1%的绘制任务。 二、人类基因组计划 人类基因组计划研究的内容: 1、遗传图谱 2、物理图谱 3、序列图谱 4、转录图谱 核心内容是绘制四张图谱: HGP研究的意义: 基因克隆 基因诊断 基因治疗 控制人体的生化特性,修复人体细胞或器官的功能。 利用基因改良蔬菜品种,提高农作物品质。 基因药物 药物开发 DNA分子标记的发展 1、1980年,第一代DNA标记—— 限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)。 2、1989年,第二代DNA标记—— 微卫星DNA或短串联重复序列(short tandem Repeat, STR) 3、1996年,第三代DNA标记—— 单核苷酸多态性标记(single nucleotide polymorphism,SNP)。 * * * * * * 第二代IDDM易感基因有: IDDM 2(11p15) IDDM3(15q26) IDDM4(11q13) IDDM5(6q25) IDDM7(2q31) Ⅰ型糖尿病 IDDM8(6q27) IDDM11(14q24.3-q31) IDDM12(2q33上的CTLA4) IDDM13(2q34) GCK3(葡萄糖激酶3,7p) 相关基因有:胰岛素基因、胰岛素受体基因、胰岛β细胞葡萄糖转运蛋白2基因、糖原合成酶基因、胰高血糖素受体基因、磺脲受体基因等。 Ⅱ型糖尿病 罗敏教授等率先将中国
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